1jb0

Crystal Structure of Photosystem I: a Photosynthetic Reaction Center and Core Antenna System from Cyanobacteria

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PHOTOSYSTEM I P700 CHLOROPHYLL A APOPROTEIN A1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 36	PHOTOSYSTEM I P700 CHLOROPHYLL A APOPROTEIN A2 × 3 （P25897） PHOTOSYSTEM I IRON-SULFUR CENTER × 3 （P18083） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT II × 3 （P20452） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT IV × 3 （P25898） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT III × 3 （P25899） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT VIII × 3 （P25900） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT IX × 3 （P25901） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT X × 3 （P20453） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT XI × 3 （P25902） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT XII × 3 （P25903） PHOTOSYSTEM I SUBUNIT PSAX × 3 CHLOROPHYLL A × 288 PHYLLOQUINONE × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BETA-CAROTENE × 66 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 9 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3 CALCIUM ION × 3 water × 30	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAA_SYNEL
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–755； UniProt 1–755

PHOTOSYSTEM I P700 CHLOROPHYLL A APOPROTEIN A2

物种未注明

UniProt P25897

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 36	PHOTOSYSTEM I P700 CHLOROPHYLL A APOPROTEIN A1 × 3 （P25896） PHOTOSYSTEM I IRON-SULFUR CENTER × 3 （P18083） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT II × 3 （P20452） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT IV × 3 （P25898） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT III × 3 （P25899） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT VIII × 3 （P25900） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT IX × 3 （P25901） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT X × 3 （P20453） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT XI × 3 （P25902） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT XII × 3 （P25903） PHOTOSYSTEM I SUBUNIT PSAX × 3 CHLOROPHYLL A × 288 PHYLLOQUINONE × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BETA-CAROTENE × 66 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 9 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3 CALCIUM ION × 3 water × 30	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAB_SYNEL
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–740； UniProt 1–740

PHOTOSYSTEM I IRON-SULFUR CENTER

物种未注明

UniProt P18083

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 36	PHOTOSYSTEM I P700 CHLOROPHYLL A APOPROTEIN A1 × 3 （P25896） PHOTOSYSTEM I P700 CHLOROPHYLL A APOPROTEIN A2 × 3 （P25897） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT II × 3 （P20452） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT IV × 3 （P25898） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT III × 3 （P25899） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT VIII × 3 （P25900） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT IX × 3 （P25901） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT X × 3 （P20453） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT XI × 3 （P25902） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT XII × 3 （P25903） PHOTOSYSTEM I SUBUNIT PSAX × 3 CHLOROPHYLL A × 288 PHYLLOQUINONE × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BETA-CAROTENE × 66 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 9 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3 CALCIUM ION × 3 water × 30	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAC_SYNEL
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–80； UniProt 1–80

PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT II

物种未注明

UniProt P20452

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 36	PHOTOSYSTEM I P700 CHLOROPHYLL A APOPROTEIN A1 × 3 （P25896） PHOTOSYSTEM I P700 CHLOROPHYLL A APOPROTEIN A2 × 3 （P25897） PHOTOSYSTEM I IRON-SULFUR CENTER × 3 （P18083） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT IV × 3 （P25898） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT III × 3 （P25899） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT VIII × 3 （P25900） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT IX × 3 （P25901） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT X × 3 （P20453） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT XI × 3 （P25902） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT XII × 3 （P25903） PHOTOSYSTEM I SUBUNIT PSAX × 3 CHLOROPHYLL A × 288 PHYLLOQUINONE × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BETA-CAROTENE × 66 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 9 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3 CALCIUM ION × 3 water × 30	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAD_SYNEL
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–138； UniProt 1–138

PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT IV

物种未注明

UniProt P25898

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 36	PHOTOSYSTEM I P700 CHLOROPHYLL A APOPROTEIN A1 × 3 （P25896） PHOTOSYSTEM I P700 CHLOROPHYLL A APOPROTEIN A2 × 3 （P25897） PHOTOSYSTEM I IRON-SULFUR CENTER × 3 （P18083） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT II × 3 （P20452） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT III × 3 （P25899） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT VIII × 3 （P25900） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT IX × 3 （P25901） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT X × 3 （P20453） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT XI × 3 （P25902） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT XII × 3 （P25903） PHOTOSYSTEM I SUBUNIT PSAX × 3 CHLOROPHYLL A × 288 PHYLLOQUINONE × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BETA-CAROTENE × 66 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 9 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3 CALCIUM ION × 3 water × 30	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAE_SYNEL
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–75； UniProt 1–75

PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT III

物种未注明

UniProt P25899

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 36	PHOTOSYSTEM I P700 CHLOROPHYLL A APOPROTEIN A1 × 3 （P25896） PHOTOSYSTEM I P700 CHLOROPHYLL A APOPROTEIN A2 × 3 （P25897） PHOTOSYSTEM I IRON-SULFUR CENTER × 3 （P18083） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT II × 3 （P20452） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT IV × 3 （P25898） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT VIII × 3 （P25900） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT IX × 3 （P25901） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT X × 3 （P20453） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT XI × 3 （P25902） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT XII × 3 （P25903） PHOTOSYSTEM I SUBUNIT PSAX × 3 CHLOROPHYLL A × 288 PHYLLOQUINONE × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BETA-CAROTENE × 66 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 9 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3 CALCIUM ION × 3 water × 30	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAF_SYNEL
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–164； UniProt 1–164

PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT VIII

物种未注明

UniProt P25900

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 36	PHOTOSYSTEM I P700 CHLOROPHYLL A APOPROTEIN A1 × 3 （P25896） PHOTOSYSTEM I P700 CHLOROPHYLL A APOPROTEIN A2 × 3 （P25897） PHOTOSYSTEM I IRON-SULFUR CENTER × 3 （P18083） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT II × 3 （P20452） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT IV × 3 （P25898） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT III × 3 （P25899） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT IX × 3 （P25901） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT X × 3 （P20453） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT XI × 3 （P25902） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT XII × 3 （P25903） PHOTOSYSTEM I SUBUNIT PSAX × 3 CHLOROPHYLL A × 288 PHYLLOQUINONE × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BETA-CAROTENE × 66 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 9 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3 CALCIUM ION × 3 water × 30	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAI_SYNEL
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38

PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT IX

物种未注明

UniProt P25901

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 36	PHOTOSYSTEM I P700 CHLOROPHYLL A APOPROTEIN A1 × 3 （P25896） PHOTOSYSTEM I P700 CHLOROPHYLL A APOPROTEIN A2 × 3 （P25897） PHOTOSYSTEM I IRON-SULFUR CENTER × 3 （P18083） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT II × 3 （P20452） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT IV × 3 （P25898） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT III × 3 （P25899） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT VIII × 3 （P25900） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT X × 3 （P20453） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT XI × 3 （P25902） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT XII × 3 （P25903） PHOTOSYSTEM I SUBUNIT PSAX × 3 CHLOROPHYLL A × 288 PHYLLOQUINONE × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BETA-CAROTENE × 66 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 9 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3 CALCIUM ION × 3 water × 30	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAJ_SYNEL
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–41； UniProt 1–41

PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT X

物种未注明

UniProt P20453

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 36	PHOTOSYSTEM I P700 CHLOROPHYLL A APOPROTEIN A1 × 3 （P25896） PHOTOSYSTEM I P700 CHLOROPHYLL A APOPROTEIN A2 × 3 （P25897） PHOTOSYSTEM I IRON-SULFUR CENTER × 3 （P18083） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT II × 3 （P20452） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT IV × 3 （P25898） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT III × 3 （P25899） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT VIII × 3 （P25900） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT IX × 3 （P25901） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT XI × 3 （P25902） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT XII × 3 （P25903） PHOTOSYSTEM I SUBUNIT PSAX × 3 CHLOROPHYLL A × 288 PHYLLOQUINONE × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BETA-CAROTENE × 66 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 9 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3 CALCIUM ION × 3 water × 30	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAK_SYNEL
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–83； UniProt 1–83

PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT XI

物种未注明

UniProt P25902

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 36	PHOTOSYSTEM I P700 CHLOROPHYLL A APOPROTEIN A1 × 3 （P25896） PHOTOSYSTEM I P700 CHLOROPHYLL A APOPROTEIN A2 × 3 （P25897） PHOTOSYSTEM I IRON-SULFUR CENTER × 3 （P18083） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT II × 3 （P20452） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT IV × 3 （P25898） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT III × 3 （P25899） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT VIII × 3 （P25900） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT IX × 3 （P25901） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT X × 3 （P20453） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT XII × 3 （P25903） PHOTOSYSTEM I SUBUNIT PSAX × 3 CHLOROPHYLL A × 288 PHYLLOQUINONE × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BETA-CAROTENE × 66 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 9 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3 CALCIUM ION × 3 water × 30	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAL_SYNEN
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–143； UniProt 1–143

PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT XII

物种未注明

UniProt P25903

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 36	PHOTOSYSTEM I P700 CHLOROPHYLL A APOPROTEIN A1 × 3 （P25896） PHOTOSYSTEM I P700 CHLOROPHYLL A APOPROTEIN A2 × 3 （P25897） PHOTOSYSTEM I IRON-SULFUR CENTER × 3 （P18083） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT II × 3 （P20452） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT IV × 3 （P25898） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT III × 3 （P25899） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT VIII × 3 （P25900） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT IX × 3 （P25901） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT X × 3 （P20453） PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT XI × 3 （P25902） PHOTOSYSTEM I SUBUNIT PSAX × 3 CHLOROPHYLL A × 288 PHYLLOQUINONE × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BETA-CAROTENE × 66 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 9 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3 CALCIUM ION × 3 water × 30	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAM_SYNEL
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–31； UniProt 1–31

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1jb0
沉积日期 deposition_date	2001-06-01
结构标题 title	Crystal Structure of Photosystem I: a Photosynthetic Reaction Center and Core Antenna System from Cyanobacteria
关键词 keywords	MEMBRANE PROTEIN, MULTIPROTEIN-PIGMENT COMPLEX, PHOTOSYNTHESIS; PHOTOSYNTHESIS
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1jb0__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1jb0__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1jb0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	69.02 Å
Rg（电子密度）	68.23 Å
总 Rg	68.13 Å
原子数	71991
残基数	6729
排除体积	1342000 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1jb0__assembly_1__model_1`	36-meric （36）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (20)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	PHOTOSYSTEM I P700 CHLOROPHYLL A APOPROTEIN A1
分子量 formula_weight	83267.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	24198

MTISPPEREPKVRVVVDNDPVPTSFEKWAKPGHFDRTLARGPQTTTWIWNLHALAHDFDTHTSDLEDISRKIFSAHFGHLAVVFIWLSGMYFHGAKFSNYEAWLADPTGIKPSAQVVWPIVGQGILNGDVGGGFHGIQITSGLFQLWRASGITNEFQLYCTAIGGLVMAGLMLFAGWFHYHKRAPKLEWFQNVESMLNHHLAGLLGLGSLAWAGHQIHVSLPINKLLDAGVAAKDIPLPHEFILNPSLMAELYPKVDWGFFSGVIPFFTFNWAAYSDFLTFNGGLNPVTGGLWLSDTAHHHLAIAVLFIIAGHMYRTNWGIGHSLKEILEAHKGPFTGAGHKGLYEVLTTSWHAQLAINLAMMGSLSIIVAQHMYAMPPYPYLATDYPTQLSLFTHHMWIGGFLVVGGAAHGAIFMVRDYDPAMNQNNVLDRVLRHRDAIISHLNWVCIFLGFHSFGLYVHNDTMRAFGRPQDMFSDTGIQLQPVFAQWVQNLHTLAPGGTAPNAAATASVAFGGDVVAVGGKVAMMPIVLGTADFMVHHIHAFTIHVTVLILLKGVLFARSSRLIPDKANLGFRFPCDGPGRGGTCQVSGWDHVFLGLFWMYNCISVVIFHFSWKMQSDVWGTVAPDGTVSHITGGNFAQSAITINGWLRDFLWAQASQVIGSYGSALSAYGLLFLGAHFIWAFSLMFLFSGRGYWQELIESIVWAHNKLKVAPAIQPRALSIIQGRAVGVAHYLLGGIATTWAFFLARIISVG

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	PHOTOSYSTEM I P700 CHLOROPHYLL A APOPROTEIN A2
分子量 formula_weight	82992.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

ATKFPKFSQDLAQDPTTRRIWYAIAMAHDFESHDGMTEENLYQKIFASHFGHLAIIFLWVSGSLFHVAWQGNFEQWVQDPVNTRPIAHAIWDPQFGKAAVDAFTQAGASNPVDIAYSGVYHWWYTIGMRTNGDLYQGAIFLLILASLALFAGWLHLQPKFRPSLSWFKNAESRLNHHLAGLFGVSSLAWAGHLIHVAIPESRGQHVGWDNFLSTMPHPAGLAPFFTGNWGVYAQNPDTASHVFGTAQGAGTAILTFLGGFHPQTESLWLTDMAHHHLAIAVLFIVAGHMYRTQFGIGHSIKEMMDAKDFFGTKVEGPFNMPHQGIYETYNNSLHFQLGWHLACLGVITSLVAQHMYSLPPYAFIAQDHTTMAALYTHHQYIAGFLMVGAFAHGAIFLVRDYDPAQNKGNVLDRVLQHKEAIISHLSWVSLFLGFHTLGLYVHNDVVVAFGTPEKQILIEPVFAQFIQAAHGKLLYGFDTLLSNPDSIASTAWPNYGNVWLPGWLDAINSGTNSLFLTIGPGDFLVHHAIALGLHTTTLILVKGALDARGSKLMPDKKDFGYAFPCDGPGRGGTCDISAWDAFYLAMFWMLNTIGWVTFYWHWKHLGVWEGNVAQFNESSTYLMGWLRDYLWLNSSQLINGYNPFGTNNLSVWAWMFLFGHLVWATGFMFLISWRGYWQELIETLVWAHERTPLANLVRWKDKPVALSIVQARLVGLAHFSVGYILTYAAFLIASTAAKFG

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	PHOTOSYSTEM I IRON-SULFUR CENTER
分子量 formula_weight	8678.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

AHTVKIYDTCIGCTQCVRACPTDVLEMVPWDGCKAGQIASSPRTEDCVGCKRCETACPTDFLSIRVYLGAETTRSMGLAY

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT II
分子量 formula_weight	15258.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

TTLTGQPPLYGGSTGGLLSAADTEEKYAITWTSPKEQVFEMPTAGAAVMREGENLVYFARKEQCLALAAQQLRPRKINDYKIYRIFPDGETVLIHPKDGVFPEKVNKGREAVNSVPRSIGQNPNPSQLKFTGKKPYDP

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT IV
分子量 formula_weight	8268.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

VQRGSKVKILRPESYWYNEVGTVASVDQTPGVKYPVIVRFDKVNYTGYSGSASGVNTNNFALHEVQEVAPPKKGK

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT III
分子量 formula_weight	17716.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MRRFLALLLVLTLWLGFTPLASADVAGLVPCKDSPAFQKRAAAAVNTTADPASGQKRFERYSQALCGEDGLPHLVVDGRLSRAGDFLIPSVLFLYIAGWIGWVGRAYLIAVRNSGEANEKEIIIDVPLAIKCMLTGFAWPLAALKELASGELTAKDNEITVSPR

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT VIII
分子量 formula_weight	4297.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MMGSYAASFLPWIFIPVVCWLMPTVVMGLLFLYIEGEA

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT IX
分子量 formula_weight	4770.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MKHFLTYLSTAPVLAAIWMTITAGILIEFNRFYPDLLFHPL

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT X
分子量 formula_weight	8484.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MVLATLPDTTWTPSVGLVVILCNLFAIALGRYAIQSRGKGPGLPIALPALFEGFGLPELLATTSFGHLLAAGVVSGLQYAGAL

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT XI
分子量 formula_weight	16156.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

AEELVKPYNGDPFVGHLSTPISDSGLVKTFIGNLPAYRQGLSPILRGLEVGMAHGYFLIGPWVKLGPLRDSDVANLGGLISGIALILVATACLAAYGLVSFQKGGSSSDPLKTSEGWSQFTAGFFVGAMGSAFVAFFLLENFLVVDGIMTGLFN

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT XII
分子量 formula_weight	3426.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

MALTDTQVYVALVIALLPAVLAFRLSTELYK

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	PHOTOSYSTEM I SUBUNIT PSAX
分子量 formula_weight	3845.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X

ATKSAKPTYAFRTFWAVLLLAINFLVAAYYFAAAA

实体 13 Entity 13 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL A
分子量 formula_weight	893.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	96

实体 14 Entity 14 non-polymer

描述 description	PHYLLOQUINONE
分子量 formula_weight	450.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 15 Entity 15 non-polymer

描述 description	IRON/SULFUR CLUSTER
分子量 formula_weight	351.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 16 Entity 16 non-polymer

描述 description	BETA-CAROTENE
分子量 formula_weight	536.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	22

实体 17 Entity 17 non-polymer

描述 description	1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE
分子量 formula_weight	723.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 18 Entity 18 non-polymer

描述 description	1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE
分子量 formula_weight	787.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 19 Entity 19 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 20 Entity 20 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	201

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 22 domains

SCOP 2.08 (13 domains)

结构域编号 domain_id	d1jb0a_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.29 — Photosystem I subunits PsaA/PsaB
超家族 Superfamily superfamily	f.29.1 — Photosystem I subunits PsaA/PsaB
家族 Family family	f.29.1.1 — Photosystem I subunits PsaA/PsaB

结构域编号 domain_id	d1jb0b_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.29 — Photosystem I subunits PsaA/PsaB
超家族 Superfamily superfamily	f.29.1 — Photosystem I subunits PsaA/PsaB
家族 Family family	f.29.1.1 — Photosystem I subunits PsaA/PsaB

结构域编号 domain_id	d1jb0c_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.58.1 — 4Fe-4S ferredoxins
家族 Family family	d.58.1.2 — 7-Fe ferredoxin

结构域编号 domain_id	d1jb0d_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.187 — Photosystem I subunit PsaD
超家族 Superfamily superfamily	d.187.1 — Photosystem I subunit PsaD
家族 Family family	d.187.1.1 — Photosystem I subunit PsaD

结构域编号 domain_id	d1jb0e_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.34 — SH3-like barrel
超家族 Superfamily superfamily	b.34.4 — Electron transport accessory proteins
家族 Family family	b.34.4.2 — Photosystem I accessory protein E (PsaE)

结构域编号 domain_id	d1jb0f_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.16 — Subunit III of photosystem I reaction centre, PsaF
家族 Family family	f.23.16.1 — Subunit III of photosystem I reaction centre, PsaF

结构域编号 domain_id	d1jb0i_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.17 — Subunit VIII of photosystem I reaction centre, PsaI
家族 Family family	f.23.17.1 — Subunit VIII of photosystem I reaction centre, PsaI

结构域编号 domain_id	d1jb0j_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.18 — Subunit IX of photosystem I reaction centre, PsaJ
家族 Family family	f.23.18.1 — Subunit IX of photosystem I reaction centre, PsaJ

结构域编号 domain_id	d1jb0k_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.30 — Photosystem I reaction center subunit X, PsaK
超家族 Superfamily superfamily	f.30.1 — Photosystem I reaction center subunit X, PsaK
家族 Family family	f.30.1.1 — Photosystem I reaction center subunit X, PsaK

结构域编号 domain_id	d1jb0l_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.31 — Photosystem I reaction center subunit XI, PsaL
超家族 Superfamily superfamily	f.31.1 — Photosystem I reaction center subunit XI, PsaL
家族 Family family	f.31.1.1 — Photosystem I reaction center subunit XI, PsaL

结构域编号 domain_id	d1jb0m_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.19 — Subunit XII of photosystem I reaction centre, PsaM
家族 Family family	f.23.19.1 — Subunit XII of photosystem I reaction centre, PsaM

结构域编号 domain_id	d1jb0x1
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.20 — Subunit PsaX of photosystem I reaction centre
家族 Family family	f.23.20.1 — Subunit PsaX of photosystem I reaction centre

结构域编号 domain_id	d1jb0x2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (9 domains)

结构域编号 domain_id	1jb0A00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1130 — Photosystem I p700 chlorophyll A apoprotein A1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem I PsaA/PsaB

结构域编号 domain_id	1jb0B00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1130 — Photosystem I p700 chlorophyll A apoprotein A1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem I PsaA/PsaB

结构域编号 domain_id	1jb0C00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	1jb0D00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1470 — Photosystem 1 Reaction Centre Subunit Ii; Chain: D;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem I PsaD, reaction center subunit II

结构域编号 domain_id	1jb0E00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 —

结构域编号 domain_id	1jb0F00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	8 — Helicase, Ruva Protein; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	110 — Photosystem I, reaction centre, subunit PsaF

结构域编号 domain_id	1jb0J00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	510 — Single helix bin

结构域编号 domain_id	1jb0K00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	860 — Alpha-t-alpha
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Photosystem I PsaK, reaction centre

结构域编号 domain_id	1jb0L00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1240 — Photosystem 1 Reaction Centre Subunit Xi; Chain: L;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem I PsaL, reaction centre subunit XI

▶

晶胞边长 a length_a	281.000 Å
晶胞边长 b length_b	281.000 Å
晶胞边长 c length_c	165.200 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 63
空间群编号 int_tables_number	173
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.500 Å
最低分辨率 resolution_low	30.000 Å
R 因子 r_factor	0.1990
R_work r_work	0.1990
R_free r_free	0.2170

Crystal Structure of Photosystem I: a Photosynthetic Reaction Center and Core Antenna System from Cyanobacteria

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PHOTOSYSTEM I P700 CHLOROPHYLL A APOPROTEIN A1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

PHOTOSYSTEM I P700 CHLOROPHYLL A APOPROTEIN A2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

PHOTOSYSTEM I IRON-SULFUR CENTER

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT II

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT IV

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT III

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT VIII

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT IX

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT X

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

PHOTOSYSTEM 1 REACTION CENTRE SUBUNIT XI

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体