SAXSdb — 1jhl

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PHEASANT EGG WHITE LYSOZYME

Phasianus colchicus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	IGG1-KAPPA D11.15 FV (LIGHT CHAIN) × 1 IGG1-KAPPA D11.15 FV (HEAVY CHAIN) × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	LYSC_PHACO
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–129； UniProt 19–147

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1jhl
沉积日期 deposition_date	1993-05-04
结构标题 title	THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF A HETEROCLITIC ANTIGEN-ANTIBODY CROSS-REACTION COMPLEX
关键词 keywords	COMPLEX(ANTIBODY-ANTIGEN); COMPLEX(ANTIBODY-ANTIGEN)
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1jhl__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1jhl__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1jhl__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	22.62 Å
Rg（电子密度）	21.81 Å
总 Rg	22.77 Å
原子数	2745
残基数	353
排除体积	48319 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1jhl__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	IGG1-KAPPA D11.15 FV (LIGHT CHAIN)
分子量 formula_weight	11841.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L
原子数 atom_count	2745

DIELTQSPSYLVASPGETITINCRASKSISKSLAWYQEKPGKTNNLLIYSGSTLQSGIPSRFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAMYICQQHNEYPWTFGGGTKLEIKR

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	house mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	IGG1-KAPPA D11.15 FV (HEAVY CHAIN)
分子量 formula_weight	13004.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

QVQLQQSGAELVRPGASVKLSCKASGYTFISYWINWVKQRPGQGLEWIGNIYPSDSYTNYNQKFKDKATLTVDKSSSTAYMQLSSPTSEDSAVYYCTRDDNYGAMDYWGQGTTVTV

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	house mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	PHEASANT EGG WHITE LYSOZYME
分子量 formula_weight	14276.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

KVYGRCELAAAMKRMGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTGATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSKNLCHIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGDGMNAWVAWRKHCKGTDVNVWIRGCRL

来源 Source

来源生物 organism	Phasianus colchicus
通用名 common_name	ring-necked pheasant
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9054

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d1jhla_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.2 — Lysozyme-like
超家族 Superfamily superfamily	d.2.1 — Lysozyme-like
家族 Family family	d.2.1.2 — C-type lysozyme

结构域编号 domain_id	d1jhlh1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

结构域编号 domain_id	d1jhlh2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d1jhll_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	1jhlA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	530 — Lysozyme
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	1jhlH00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1jhlL00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

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晶胞边长 a length_a	57.800 Å
晶胞边长 b length_b	57.800 Å
晶胞边长 c length_c	282.100 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 65
空间群编号 int_tables_number	170
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.400 Å
最低分辨率 resolution_low	7.000 Å
R 因子 r_factor	0.2140
R_work r_work	0.2140
R_free r_free	—

THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF A HETEROCLITIC ANTIGEN-ANTIBODY CROSS-REACTION COMPLEX

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PHEASANT EGG WHITE LYSOZYME

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1jhl__assembly_1__model_1

1jhl__assembly_1__model_1 | I(q)

1jhl__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)

THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF A HETEROCLITIC ANTIGEN-ANTIBODY CROSS-REACTION COMPLEX

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PHEASANT EGG WHITE LYSOZYME

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1jhl__assembly_1__model_1

1jhl__assembly_1__model_1 | I(q)

1jhl__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)