1jmb

CRYSTAL STRUCTURE OF FOUR-HELIX BUNDLE MODEL

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

当前条目没有可用的 UniProt 蛋白身份。

七张关系表仍保留该条目的 assembly 与组成信息,但缺少统一蛋白身份时,不能可靠建立跨 PDB 的同蛋白链接。

当前条目的 assembly 组成

Assembly 物理组成 蛋白状态 蛋白 / DNA / RNA / 其他聚合物 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 2 / 0 / 0 / 0 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 2 / 0 / 0 / 0 与蛋白数一致

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1jmb
沉积日期 deposition_date2001-07-18
结构标题 titleCRYSTAL STRUCTURE OF FOUR-HELIX BUNDLE MODEL
关键词 keywordsALPHA-HELICAL BUNDLE, PROTEIN DESIGN, DE NOVO PROTEIN; DE NOVO PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1jmb__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1jmb__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1jmb__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)14.16 Å
Rg(电子密度)13.13 Å
总 Rg14.34 Å
原子数836
残基数96
排除体积15380 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1jmb__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1jmb__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd1jmba_
类 Class classk — Designed proteins
折叠类型 Fold foldk.8 — Designed four-helix bundle protein
超家族 Superfamily superfamilyk.8.1 — Designed four-helix bundle protein
家族 Family familyk.8.1.1 — Designed four-helix bundle protein
结构域编号 domain_idd1jmbb_
类 Class classk — Designed proteins
折叠类型 Fold foldk.8 — Designed four-helix bundle protein
超家族 Superfamily superfamilyk.8.1 — Designed four-helix bundle protein
家族 Family familyk.8.1.1 — Designed four-helix bundle protein
结构域编号 domain_idd1jmbc_
类 Class classk — Designed proteins
折叠类型 Fold foldk.8 — Designed four-helix bundle protein
超家族 Superfamily superfamilyk.8.1 — Designed four-helix bundle protein
家族 Family familyk.8.1.1 — Designed four-helix bundle protein

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id1jmbA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily420 — Immunoglobulin FC, subunit C
结构域编号 domain_id1jmbB00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily420 — Immunoglobulin FC, subunit C
结构域编号 domain_id1jmbC00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily420 — Immunoglobulin FC, subunit C
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7. 引用文献 (4)