物种未注明
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Peptide inhibitor × 1 ACETIC ACID × 3 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | ACETIC ACID × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| 3 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 3 | Peptide inhibitor × 1 ACETIC ACID × 4 water × 3 | 与蛋白数一致 |
| 4 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 3 | Peptide inhibitor × 1 ACETIC ACID × 4 water × 3 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | PA28_DABRP |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–121； UniProt 1–121 作者链 B； PDB构建体 1–121； UniProt 1–121 |
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| 条目编号 entry_id | 1jq9 |
| 沉积日期 deposition_date | 2001-08-04 |
| 结构标题 title | Crystal structure of a complex formed between phospholipase A2 from Daboia russelli pulchella and a designed pentapeptide Phe-Leu-Ser-Tyr-Lys at 1.8 resolution |
| 关键词 keywords | phospholipase A2, Daboia russelli pulchella, neurotoxic, designed peptide, HYDROLASE, HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR COMPLEX; HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 3 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 18.80 Å |
| Rg（电子密度） | 18.09 Å |
| 总 Rg | 19.07 Å |
| 原子数 | 1951 |
| 残基数 | 247 |
| 排除体积 | 34768 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 1jq9__assembly_1__model_1 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 2 | 1 | 1jq9__assembly_2__model_1 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 3 | 1 | 1jq9__assembly_3__model_1 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 4 | 1 | 1jq9__assembly_4__model_1 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 结构域编号 domain_id | d1jq9a_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.133 — Phospholipase A2, PLA2 |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.133.1 — Phospholipase A2, PLA2 |
| 家族 Family family | a.133.1.2 — Vertebrate phospholipase A2 |
| 结构域编号 domain_id | d1jq9b_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.133 — Phospholipase A2, PLA2 |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.133.1 — Phospholipase A2, PLA2 |
| 家族 Family family | a.133.1.2 — Vertebrate phospholipase A2 |
| 结构域编号 domain_id | 1jq9A00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 90 — Phospholipase A2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Phospholipase A2 domain |
| 结构域编号 domain_id | 1jq9B00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 90 — Phospholipase A2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Phospholipase A2 domain |