1jy4

B4DIMER: A DE NOVO DESIGNED EIGHT-STRANDED BETA-SHEET ASSEMBLED USING A DISULFIDE BOND

Method: SOLUTION NMR
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

当前条目没有可用的 UniProt 蛋白身份。

七张关系表仍保留该条目的 assembly 与组成信息,但缺少统一蛋白身份时,不能可靠建立跨 PDB 的同蛋白链接。

当前条目的 assembly 组成

Assembly 物理组成 蛋白状态 蛋白 / DNA / RNA / 其他聚合物 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 2 / 0 / 0 / 0 与蛋白数一致

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1jy4
沉积日期 deposition_date2001-09-11
结构标题 titleB4DIMER: A DE NOVO DESIGNED EIGHT-STRANDED BETA-SHEET ASSEMBLED USING A DISULFIDE BOND
关键词 keywordseight-stranded beta-sheet, disulfide bond, de novo protein design, DE NOVO PROTEIN; DE NOVO PROTEIN
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1jy4__assembly_1__model_8

Assembly 1 · Model 8 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1jy4__assembly_1__model_8 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1jy4__assembly_1__model_8 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)16.09 Å
Rg(电子密度)15.36 Å
总 Rg16.44 Å
原子数1036
残基数64
排除体积10015 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1jy4__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 1jy4__assembly_1__model_2 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 1jy4__assembly_1__model_3 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 1jy4__assembly_1__model_4 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 1jy4__assembly_1__model_5 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 1jy4__assembly_1__model_6 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 1jy4__assembly_1__model_7 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 1jy4__assembly_1__model_8 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 1jy4__assembly_1__model_9 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 1jy4__assembly_1__model_10 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd1jy4a_
类 Class classk — Designed proteins
折叠类型 Fold foldk.35 — Beta-sheet designs
超家族 Superfamily superfamilyk.35.1 — Beta-sheet designs
家族 Family familyk.35.1.1 — Beta-sheet designs
结构域编号 domain_idd1jy4b_
类 Class classk — Designed proteins
折叠类型 Fold foldk.35 — Beta-sheet designs
超家族 Superfamily superfamilyk.35.1 — Beta-sheet designs
家族 Family familyk.35.1.1 — Beta-sheet designs
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7. 引用文献 (1)