Porcine parvovirus
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 60 | 无其他共同聚合物 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | 无其他共同聚合物 | 与蛋白数一致 |
| 3 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 5 | 无其他共同聚合物 | 与蛋白数一致 |
| 4 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 6 | 无其他共同聚合物 | 与蛋白数一致 |
| 5 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | 无其他共同聚合物 | 与蛋白数一致 |
| 6 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 60 | 无其他共同聚合物 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | COA1_PAVPN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–579； UniProt 151–729 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
| 条目编号 entry_id | 1k3v |
| 沉积日期 deposition_date | 2001-10-04 |
| 结构标题 title | Porcine Parvovirus Capsid |
| 关键词 keywords | capsid, icosahadral, beta sheet, Icosahedral virus, Virus; VIRUS |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 0.00 Å |
| Rg（电子密度） | 110.00 Å |
| 总 Rg | 110.10 Å |
| 原子数 | 258360 |
| 残基数 | 32520 |
| 排除体积 | 4555300 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 1k3v__assembly_1__model_1 |
complete icosahedral assembly （60） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 2 | 1 | 1k3v__assembly_2__model_1 |
monomeric （1） | 排除 | — | — |
| 排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。 | ||||||
| 3 | 1 | 1k3v__assembly_3__model_1 |
pentameric （5） | 排除 | — | — |
| 排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。 | ||||||
| 4 | 1 | 1k3v__assembly_4__model_1 |
hexameric （6） | 排除 | — | — |
| 排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。 | ||||||
| 5 | 1 | 1k3v__assembly_5__model_1 |
monomeric （1） | 排除 | — | — |
| 排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。 | ||||||
| 6 | 1 | 1k3v__assembly_6__model_1 |
60-meric （60） | 排除 | — | — |
| 排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。 | ||||||
| 结构域编号 domain_id | d1k3va_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.121 — Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins) |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.121.5 — ssDNA viruses |
| 家族 Family family | b.121.5.2 — Parvoviridae-like VP |
| 结构域编号 domain_id | 1k3vA00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 170 — Beta Complex |
| 拓扑 Topology topology | 30 — Empty Capsid Viral Protein 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Parvovirus coat protein VP1/VP2 |