Xylanase
Rhodothermus marinus
当前结构中的状态
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | 无其他共同聚合物 | 与蛋白数一致 |
数据库中的同蛋白其他状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | P96988_RHOMR |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 2–164； UniProt 211–373 |
1k42
The Solution Structure of the CBM4-2 Carbohydrate Binding Module from a Thermostable Rhodothermus marinus Xylanase.
1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
2. 结构基本信息 2. Structure Basics
| 条目编号 entry_id | 1k42 |
| 沉积日期 deposition_date | 2001-10-05 |
| 结构标题 title | The Solution Structure of the CBM4-2 Carbohydrate Binding Module from a Thermostable Rhodothermus marinus Xylanase. |
| 关键词 keywords | ;beta-sandwich formed by 11 strands. Binding-site cleft. Solvent exposed aromatics (Trp69, Phe110) in binding cleft. Two helical twists. Two calcium binding sites., Hydrolase ;; HYDROLASE |
| 实验方法 method | SOLUTION NMR |
3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
1k42__assembly_1__model_8
Assembly 1 · Model 8 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
1k42__assembly_1__model_8 | I(q)
1k42__assembly_1__model_8 | P(r) · Pending
| Rg（Guinier） | 16.47 Å |
| Rg（电子密度） | 15.09 Å |
| 总 Rg | 16.28 Å |
| 原子数 | 2490 |
| 残基数 | 168 |
| 排除体积 | 22531 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 1k42__assembly_1__model_1 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 2 | 1k42__assembly_1__model_2 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 3 | 1k42__assembly_1__model_3 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 4 | 1k42__assembly_1__model_4 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 5 | 1k42__assembly_1__model_5 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 6 | 1k42__assembly_1__model_6 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 7 | 1k42__assembly_1__model_7 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 8 | 1k42__assembly_1__model_8 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 9 | 1k42__assembly_1__model_9 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 10 | 1k42__assembly_1__model_10 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 11 | 1k42__assembly_1__model_11 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 12 | 1k42__assembly_1__model_12 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment
5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)
6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains
SCOP 2.08 (2 domains)
| 结构域编号 domain_id | d1k42a1 |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.18 — Galactose-binding domain-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.18.1 — Galactose-binding domain-like |
| 家族 Family family | b.18.1.14 — CBM4/9 |
| 结构域编号 domain_id | d1k42a2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
CATH v4.4 (1 domains)
| 结构域编号 domain_id | 1k42A00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 120 — Jelly Rolls |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 260 — Galactose-binding domain-like |