Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 同源多聚体 | 蛋白 2 DNA 2 | 5'-D(*CP*AP*CP*GP*GP*TP*TP*CP*AP*CP*GP*AP*GP*GP*TP*TP*CP*A)-3' × 1 5'-D(*TP*GP*AP*AP*CP*CP*TP*CP*GP*TP*GP*AP*AP*CP*CP*GP*TP*G)-3' × 1 ZINC ION × 4 water × 4 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | VDR_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 3 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–110； UniProt 16–125 作者链 B； PDB构建体 1–110； UniProt 16–125 |
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| 条目编号 entry_id | 1kb2 |
| 沉积日期 deposition_date | 2001-11-05 |
| 结构标题 title | Crystal Structure of VDR DNA-binding Domain Bound to Mouse Osteopontin (SPP) Response Element |
| 关键词 keywords | VDR, NUCLEAR RECEPTOR, PROTEIN-DNA COMPLEX, VITAMIN D, TRANSCRIPTION-DNA COMPLEX; TRANSCRIPTION/DNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 21.66 Å |
| Rg（电子密度） | 21.41 Å |
| 总 Rg | 22.04 Å |
| 原子数 | 2100 |
| 残基数 | 210 |
| 排除体积 | 34943 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d1kb2a_ |
| 类 Class class | g — Small proteins |
| 折叠类型 Fold fold | g.39 — Glucocorticoid receptor-like (DNA-binding domain) |
| 超家族 Superfamily superfamily | g.39.1 — Glucocorticoid receptor-like (DNA-binding domain) |
| 家族 Family family | g.39.1.2 — Nuclear receptor |
| 结构域编号 domain_id | d1kb2b_ |
| 类 Class class | g — Small proteins |
| 折叠类型 Fold fold | g.39 — Glucocorticoid receptor-like (DNA-binding domain) |
| 超家族 Superfamily superfamily | g.39.1 — Glucocorticoid receptor-like (DNA-binding domain) |
| 家族 Family family | g.39.1.2 — Nuclear receptor |
| 结构域编号 domain_id | 1kb2A00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 50 — Erythroid Transcription Factor GATA-1; Chain A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Erythroid Transcription Factor GATA-1, subunit A |
| 结构域编号 domain_id | 1kb2B00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 50 — Erythroid Transcription Factor GATA-1; Chain A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Erythroid Transcription Factor GATA-1, subunit A |