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1kbo

Complex of Human recombinant NAD(P)H:Quinone Oxide reductase type 1 with 5-methoxy-1,2-dimethyl-3-(phenoxymethyl)indole-4,7-dione (ES1340)

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NAD(P)H dehydrogenase [quinone] 1

Homo sapiens

UniProt P15559

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 5-METHOXY-1,2-DIMETHYL-3-(PHENOXYMETHYL)INDOLE-4,7-DIONE × 2 FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 5-METHOXY-1,2-DIMETHYL-3-(PHENOXYMETHYL)INDOLE-4,7-DIONE × 2 FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
1qbg 1qbg 1qbg 1qbg

共 4 个 assembly

同源二聚体
1d4a 1d4a 1dxo 1dxo 1gg5 1gg5 1h66 1h66 1h69 1h69 1kbo 1kbo

共 54 个 assembly，这里只显示前 12 个

同源四聚体
8ok0 8rfm 8rfn 9ezq 9ezs 9ezt

共 6 个 assembly

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物

暂无

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NQO1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–273； UniProt 2–274 作者链 B； PDB构建体 1–273； UniProt 2–274 作者链 C； PDB构建体 1–273； UniProt 2–274 作者链 D； PDB构建体 1–273； UniProt 2–274

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1kbo
沉积日期 deposition_date2001-11-06
结构标题 titleComplex of Human recombinant NAD(P)H:Quinone Oxide reductase type 1 with 5-methoxy-1,2-dimethyl-3-(phenoxymethyl)indole-4,7-dione (ES1340)
关键词 keywordsFLAVOENZYME, PRODRUG-ENZYME COMPLEX, OXIDOREDUCTASE; OXIDOREDUCTASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1kbo__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1kbo__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1kbo__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）24.07 Å
Rg（电子密度）22.65 Å
总 Rg23.74 Å
原子数4502
残基数546
排除体积80606 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1kbo__assembly_1__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1kbo__assembly_2__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd1kboa_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.23 — Flavodoxin-like
超家族 Superfamily superfamilyc.23.5 — Flavoproteins
家族 Family familyc.23.5.3 — Quinone reductase
结构域编号 domain_idd1kbob_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.23 — Flavodoxin-like
超家族 Superfamily superfamilyc.23.5 — Flavoproteins
家族 Family familyc.23.5.3 — Quinone reductase
结构域编号 domain_idd1kboc_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.23 — Flavodoxin-like
超家族 Superfamily superfamilyc.23.5 — Flavoproteins
家族 Family familyc.23.5.3 — Quinone reductase
结构域编号 domain_idd1kbod_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.23 — Flavodoxin-like
超家族 Superfamily superfamilyc.23.5 — Flavoproteins
家族 Family familyc.23.5.3 — Quinone reductase

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1kboA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily360 — Flavodoxin domain
结构域编号 domain_id1kboB00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily360 — Flavodoxin domain
结构域编号 domain_id1kboC00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily360 — Flavodoxin domain
结构域编号 domain_id1kboD00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily360 — Flavodoxin domain
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7. 引用文献 (3)