SAXSdb — 1kig

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

FACTOR XA

Bos taurus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	ANTICOAGULANT PEPTIDE × 1 （P17726）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FA10_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	1, 2
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–241； UniProt 234–474 作者链 L； PDB构建体 1–51； UniProt 129–179

ANTICOAGULANT PEPTIDE

Ornithodoros moubata

UniProt P17726

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	FACTOR XA × 1 （P00743） FACTOR XA × 1 （P00743）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TAP_ORNMO
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–60； UniProt 1–60

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1kig
沉积日期 deposition_date	1997-04-24
结构标题 title	BOVINE FACTOR XA
关键词 keywords	GLYCOPROTEIN, SERINE PROTEASE, PLASMA, BLOOD COAGULATION, COMPLEX (PROTEASE-INHIBITOR), COMPLEX (PROTEASE-INHIBITOR) complex; COMPLEX (PROTEASE/INHIBITOR)
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1kig__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1kig__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1kig__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	22.12 Å
Rg（电子密度）	20.97 Å
总 Rg	21.81 Å
原子数	2756
残基数	352
排除体积	48228 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1kig__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	FACTOR XA
分子量 formula_weight	26847.5 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.21.6
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H
原子数 atom_count	2756

IVGGRDCAEGECPWQALLVNEENEGFCGGTILNEFYVLTAAHCLHQAKRFTVRVGDRNTEQEEGNEMAHEVEMTVKHSRFVKETYDFDIAVLRLKTPIRFRRNVAPACLPEKDWAEATLMTQKTGIVSGFGRTHEKGRLSSTLKMLEVPYVDRSTCKLSSSFTITPNMFCAGYDTQPEDACQGDSGGPHVTRFKDTYFVTGIVSWGEGCARKGKFGVYTKVSNFLKWIDKIMKARAGAAGS

来源 Source

来源生物 organism	Bos taurus
通用名 common_name	cattle
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9913
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	FACTOR XA
分子量 formula_weight	5633.2 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.21.6
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

CSLDNGGCDQFCREERSEVRCSCAHGYVLGDDSKSCVSTERFPCGKFTQGR

来源 Source

来源生物 organism	Bos taurus
通用名 common_name	cattle
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9913
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	ANTICOAGULANT PEPTIDE
分子量 formula_weight	6992.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

YNRLCIKPRDWIDECDSNEGGERAYFRNGKGGCDSFWICPEDHTGADYYSSYRDCFNACI

来源 Source

来源生物 organism	Ornithodoros moubata
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	6938
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_id	d1kigh_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.47 — Trypsin-like serine proteases
超家族 Superfamily superfamily	b.47.1 — Trypsin-like serine proteases
家族 Family family	b.47.1.2 — Eukaryotic proteases

结构域编号 domain_id	d1kigi_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.8 — BPTI-like
超家族 Superfamily superfamily	g.8.1 — BPTI-like
家族 Family family	g.8.1.2 — Soft tick anticoagulant proteins

结构域编号 domain_id	d1kigl_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.3 — Knottins (small inhibitors, toxins, lectins)
超家族 Superfamily superfamily	g.3.11 — EGF/Laminin
家族 Family family	g.3.11.1 — EGF-type module

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	1kigH01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Trypsin-like serine proteases

结构域编号 domain_id	1kigH02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Trypsin-like serine proteases

结构域编号 domain_id	1kigI00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	410 — Factor Xa Inhibitor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Pancreatic trypsin inhibitor Kunitz domain

结构域编号 domain_id	1kigL00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	25 — Laminin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Laminin

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晶胞边长 a length_a	133.100 Å
晶胞边长 b length_b	133.100 Å
晶胞边长 c length_c	68.800 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 42 21 2
空间群编号 int_tables_number	94
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.000 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	0.1870
R_work r_work	0.1870
R_free r_free	—

BOVINE FACTOR XA

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

FACTOR XA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

ANTICOAGULANT PEPTIDE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1kig__assembly_1__model_1

1kig__assembly_1__model_1 | I(q)

1kig__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

BOVINE FACTOR XA

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

FACTOR XA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ANTICOAGULANT PEPTIDE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1kig__assembly_1__model_1

1kig__assembly_1__model_1 | I(q)

1kig__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)