1kj1

MANNOSE-SPECIFIC AGGLUTININ (LECTIN) FROM GARLIC (ALLIUM SATIVUM) BULBS COMPLEXED WITH ALPHA-D-MANNOSE

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

lectin I

物种未注明

UniProt Q38789

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 lectin II × 1 (Q38783) alpha-D-mannopyranose × 7 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 lectin II × 1 (Q38783) alpha-D-mannopyranose × 7 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q38789_ALLSA
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–109; UniProt 177–284 作者链 P; PDB构建体 1–109; UniProt 177–284

lectin II

物种未注明

UniProt Q38783

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 lectin I × 1 (Q38789) alpha-D-mannopyranose × 7 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 lectin I × 1 (Q38789) alpha-D-mannopyranose × 7 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q38783_ALLSA
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–109; UniProt 29–137 作者链 Q; PDB构建体 1–109; UniProt 29–137

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1kj1
沉积日期 deposition_date2001-12-04
结构标题 titleMANNOSE-SPECIFIC AGGLUTININ (LECTIN) FROM GARLIC (ALLIUM SATIVUM) BULBS COMPLEXED WITH ALPHA-D-MANNOSE
关键词 keywordsBULB LECTIN, MANNOSE, PLANT PROTEIN; PLANT PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1kj1__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1kj1__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1kj1__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)19.83 Å
Rg(电子密度)19.00 Å
总 Rg19.87 Å
原子数1785
残基数218
排除体积31344 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1kj1__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1kj1__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd1kj1a_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.78 — beta-Prism II
超家族 Superfamily superfamilyb.78.1 — alpha-D-mannose-specific plant lectins
家族 Family familyb.78.1.1 — alpha-D-mannose-specific plant lectins
结构域编号 domain_idd1kj1d_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.78 — beta-Prism II
超家族 Superfamily superfamilyb.78.1 — alpha-D-mannose-specific plant lectins
家族 Family familyb.78.1.1 — alpha-D-mannose-specific plant lectins
结构域编号 domain_idd1kj1p_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.78 — beta-Prism II
超家族 Superfamily superfamilyb.78.1 — alpha-D-mannose-specific plant lectins
家族 Family familyb.78.1.1 — alpha-D-mannose-specific plant lectins
结构域编号 domain_idd1kj1q_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.78 — beta-Prism II
超家族 Superfamily superfamilyb.78.1 — alpha-D-mannose-specific plant lectins
家族 Family familyb.78.1.1 — alpha-D-mannose-specific plant lectins

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1kj1A00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture90 — Orthogonal Prism
拓扑 Topology topology10 — Agglutinin, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Bulb-type lectin domain
结构域编号 domain_id1kj1D00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture90 — Orthogonal Prism
拓扑 Topology topology10 — Agglutinin, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Bulb-type lectin domain
结构域编号 domain_id1kj1P00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture90 — Orthogonal Prism
拓扑 Topology topology10 — Agglutinin, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Bulb-type lectin domain
结构域编号 domain_id1kj1Q00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture90 — Orthogonal Prism
拓扑 Topology topology10 — Agglutinin, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Bulb-type lectin domain
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7. 引用文献 (3)