SAXSdb — 1kn2

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

IG ANTIBODY D2.3 (LIGHT CHAIN)

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 L； UniProt 21–239	未记录	IG ANTIBODY D2.3 (HEAVY CHAIN) × 1 ZN ZINC ION × 7 PNE PARA-NITROPHENYL PHOSPHONOBUTANOYL L-ALANINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；PEG600, ZnSO4, cacodylate, pH 7.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 1.90 Å R-free 0.238
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 L； UniProt 21–239	未记录	IG ANTIBODY D2.3 (HEAVY CHAIN) × 2 ZN ZINC ION × 14 PNE PARA-NITROPHENYL PHOSPHONOBUTANOYL L-ALANINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；PEG600, ZnSO4, cacodylate, pH 7.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 1.90 Å R-free 0.238
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 L； UniProt 21–239	未记录	IG ANTIBODY D2.3 (HEAVY CHAIN) × 2 ZN ZINC ION × 14 PNE PARA-NITROPHENYL PHOSPHONOBUTANOYL L-ALANINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；PEG600, ZnSO4, cacodylate, pH 7.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 1.90 Å R-free 0.238
4	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 L； UniProt 21–239	未记录	IG ANTIBODY D2.3 (HEAVY CHAIN) × 1 ZN ZINC ION × 7 PNE PARA-NITROPHENYL PHOSPHONOBUTANOYL L-ALANINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；PEG600, ZnSO4, cacodylate, pH 7.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 1.90 Å R-free 0.238

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1KN2	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1KN4 CATALYTIC ANTIBODY D2.3 COMPLEX 提交 2001-12-18	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 21–239（219 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7 PDE PARA-NITROPHENYL PHOSPHONOBUTANOYL D-ALANINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；PEG600, ZnSO4, Cacodylate, pH 7.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 1.90 Å R-free 0.246
1KN4 CATALYTIC ANTIBODY D2.3 COMPLEX 提交 2001-12-18	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 L 21–239（219 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 14 PDE PARA-NITROPHENYL PHOSPHONOBUTANOYL D-ALANINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；PEG600, ZnSO4, Cacodylate, pH 7.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 1.90 Å R-free 0.246
1KN4 CATALYTIC ANTIBODY D2.3 COMPLEX 提交 2001-12-18	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 L 21–239（219 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 14 PDE PARA-NITROPHENYL PHOSPHONOBUTANOYL D-ALANINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；PEG600, ZnSO4, Cacodylate, pH 7.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 1.90 Å R-free 0.246
1KN4 CATALYTIC ANTIBODY D2.3 COMPLEX 提交 2001-12-18	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 21–239（219 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7 PDE PARA-NITROPHENYL PHOSPHONOBUTANOYL D-ALANINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；PEG600, ZnSO4, Cacodylate, pH 7.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 1.90 Å R-free 0.246
1ND0 CATIONIC CYCLIZATION ANTIBODY 4C6 COMPLEX WITH TRANSITION STATE ANALOG 提交 2002-12-05	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 21–239（219 aa）片段：IMMUNOGLOBULIN FAB FRAGMENT, light chain 链 C 21–239（219 aa）片段：IMMUNOGLOBULIN FAB FRAGMENT, light chain	未记录	DP4 (1s,4s)-4-[dimethyl(phenyl)silyl]-1-methylpiperidine 1-oxide × 2 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；295 K；ammonium sulfate, dioxane, tri-sodium citrate dihydrate, pH 5.5, evaporation, temperature 295K	分辨率 2.45 Å R-free 0.286
1ND0 CATIONIC CYCLIZATION ANTIBODY 4C6 COMPLEX WITH TRANSITION STATE ANALOG 提交 2002-12-05	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 21–239（219 aa）片段：IMMUNOGLOBULIN FAB FRAGMENT, light chain 链 G 21–239（219 aa）片段：IMMUNOGLOBULIN FAB FRAGMENT, light chain	未记录	DP4 (1s,4s)-4-[dimethyl(phenyl)silyl]-1-methylpiperidine 1-oxide × 2 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；295 K；ammonium sulfate, dioxane, tri-sodium citrate dihydrate, pH 5.5, evaporation, temperature 295K	分辨率 2.45 Å R-free 0.286
1ND0 CATIONIC CYCLIZATION ANTIBODY 4C6 COMPLEX WITH TRANSITION STATE ANALOG 提交 2002-12-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 21–239（219 aa）片段：IMMUNOGLOBULIN FAB FRAGMENT, light chain	未记录	DP4 (1s,4s)-4-[dimethyl(phenyl)silyl]-1-methylpiperidine 1-oxide × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；295 K；ammonium sulfate, dioxane, tri-sodium citrate dihydrate, pH 5.5, evaporation, temperature 295K	分辨率 2.45 Å R-free 0.286
1ND0 CATIONIC CYCLIZATION ANTIBODY 4C6 COMPLEX WITH TRANSITION STATE ANALOG 提交 2002-12-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 21–239（219 aa）片段：IMMUNOGLOBULIN FAB FRAGMENT, light chain	未记录	DP4 (1s,4s)-4-[dimethyl(phenyl)silyl]-1-methylpiperidine 1-oxide × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；295 K；ammonium sulfate, dioxane, tri-sodium citrate dihydrate, pH 5.5, evaporation, temperature 295K	分辨率 2.45 Å R-free 0.286
1ND0 CATIONIC CYCLIZATION ANTIBODY 4C6 COMPLEX WITH TRANSITION STATE ANALOG 提交 2002-12-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 21–239（219 aa）片段：IMMUNOGLOBULIN FAB FRAGMENT, light chain	未记录	DP4 (1s,4s)-4-[dimethyl(phenyl)silyl]-1-methylpiperidine 1-oxide × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；295 K；ammonium sulfate, dioxane, tri-sodium citrate dihydrate, pH 5.5, evaporation, temperature 295K	分辨率 2.45 Å R-free 0.286
1ND0 CATIONIC CYCLIZATION ANTIBODY 4C6 COMPLEX WITH TRANSITION STATE ANALOG 提交 2002-12-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 21–239（219 aa）片段：IMMUNOGLOBULIN FAB FRAGMENT, light chain	未记录	DP4 (1s,4s)-4-[dimethyl(phenyl)silyl]-1-methylpiperidine 1-oxide × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；295 K；ammonium sulfate, dioxane, tri-sodium citrate dihydrate, pH 5.5, evaporation, temperature 295K	分辨率 2.45 Å R-free 0.286
1RU9 Crystal Structure (A) of u.v.-irradiated cationic cyclization antibody 4C6 Fab at pH 4.6 with a data set collected in-house. 提交 2003-12-11	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 21–239（219 aa）片段：fab	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 5 ACT ACETATE ION × 1 BEZ BENZOIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；295 K；0.1M sodium acetate, pH 4.6, 0.2 M ammonium acetate, 15% (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.50 Å R-free 0.247
1RUA Crystal structure (B) of u.v.-irradiated cationic cyclization antibody 4C6 fab at pH 4.6 with a data set collected at SSRL beamline 11-1. 提交 2003-12-11	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 21–239（219 aa）片段：fab	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ACT ACETATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 BEZ BENZOIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；295 K；0.1M sodium acetate, 0.2 M ammonium acetate, 15% (w/v) PEG 4000, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.75 Å R-free 0.251
1RUK Crystal structure (C) of native cationic cyclization antibody 4C6 fab at pH 4.6 with a data set collected at SSRL beamline 9-1 提交 2003-12-11	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 21–239（219 aa）片段：fab	未记录	ACT ACETATE ION × 1 BEZ BENZOIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；295 K；0.1M sodium acetate, 0.2 M ammonium acetate, 15% (w/v) PEG 4000, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.40 Å R-free 0.210
1RUL Crystal Structure (D) of u.v.-irradiated cationic cyclization antibody 4C6 Fab at pH 5.6 with a data set collected at SSRL beamline 11-1. 提交 2003-12-11	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 21–239（219 aa）片段：fab	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ACT ACETATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 4 BEZ BENZOIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；295 K；0.1 M tri-sodium citrate, 0.2M ammonium acetate, 15% (w/v) PEG 4000, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.88 Å R-free 0.283
1RUM Crystal structure (F) of H2O2-soaked cationic cyclization antibody 4C6 fab at pH 8.5 with a data set collected at SSRL beamline 9-1. 提交 2003-12-11	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 21–239（219 aa）片段：fab	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	BEZ BENZOIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295 K；0.1 M tris hydrochloride, pH 8.5, 0.2 M sodium acetate, 15% (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.48 Å R-free 0.245
1RUP Crystal structure (G) of native cationic cyclization antibody 4C6 fab at pH 8.5 with a data set collected at APS beamline 19-ID 提交 2003-12-11	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 21–239（219 aa）片段：fab	未记录	BEZ BENZOIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295 K；0.1 M tris hydrochloride, 0.2 M sodium acetate, 15% (w/v) PEG 4000 , pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.40 Å R-free 0.212

共 8 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q8K0F8_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–219； UniProt 21–239

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1kn2
沉积日期 deposition_date	2001-12-18
结构标题 title	CATALYTIC ANTIBODY D2.3 COMPLEX
关键词 keywords	ABZYME, TRANSITION STATE ANALOG, IMMUNE SYSTEM; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	26.02 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	24.91 Å
零角强度 I(0) i0	41247400.00
分子量 molecular_weight	48985.0 kDa
排除体积 excluded_volume	60811 Å³
包络体积 envelope_volume	74792 Å³
水化壳体积 shell_volume	25323 Å³
包络直径 envelope_diameter	87.5 Å
壳层 Rg shell_rg	31.79 Å
包络 Rg envelope_rg	24.54 Å
形状 Rg shape_rg	24.79 Å
总 Rg total_rg	26.01 Å
总原子数 total_atoms	3420
残基数 n_residues	426
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	83.2 Å
Rg (实空间) rg_real	26.02 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.56 Å
I(0) (实空间) i0_real	4.1250e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.4860e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	26.02 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	41250000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9068
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	28.6 Å
偏度 Skewness skewness	0.297
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.497
角度范围 angular_range	— – 0.3050 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	7846000.0000
实空间数据点数 n_real_points	62
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.941; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.981; Smooth: 0.980

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	IG ANTIBODY D2.3 (LIGHT CHAIN)
分子量 formula_weight	24019.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L
原子数 atom_count	3570

DIVMTQSPLTLSVTIGQPASISCKSSQSLLYSNGKTYLNWLLQRPGQSPKRLIHLVSKLDSGVPDRITGSGSGTDFTLKISRVEAADLGVYYCVQGTHFPYTFGGGTKLEILRADAAPTVSIFPPSSEQLTSGGASVVCFLNNFYPKDINVKWKIDGSERQNGVLNSWTDQDSKDSTYSMSSTLTLTKDEYERHNSYTCEATHKTSTSPIVKSFNRNEC

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	IG ANTIBODY D2.3 (HEAVY CHAIN)
分子量 formula_weight	24189.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

EMQLQQSGAELLRPGTSVKLSCKTSGYIFTSYWIHWVKQRSGQGLEWIARIYPGTGSTYYNEKFKGKATLTADKSSSTAYMQLSTLKSEDSAVYFCTRWGFIPVREDYVMDYWGQGTLVTVSSAKTTAPSVYPLAPVCGDTTGSSVTLGCLVKGYFPEPVTLTWNSGSLSSGVHTFPAVLQSDLYTLSSSVTVTSSTWPSQSITCNVAHPASSTKVDKKIEP

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	PARA-NITROPHENYL PHOSPHONOBUTANOYL L-ALANINE
分子量 formula_weight	360.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	150

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d1kn2h1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

结构域编号 domain_id	d1kn2h2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)

结构域编号 domain_id	d1kn2l1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

结构域编号 domain_id	d1kn2l2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	1kn2H01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1kn2H02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1kn2L01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1kn2L02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	78.275 Å
晶胞边长 b length_b	78.275 Å
晶胞边长 c length_c	158.952 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 31 2 1
空间群编号 int_tables_number	152
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.900 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2130
R_free r_free	0.2380

fit	/app/data/saxs_computation/kn/1kn2/1kn2.fit
pddf	/app/data/pr_computation/kn/1kn2/1kn2.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/kn/1kn2/1kn2.dat

CATALYTIC ANTIBODY D2.3 COMPLEX

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

IG ANTIBODY D2.3 (LIGHT CHAIN)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)