SAXSdb — 1kpl

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

putative ClC family, chlorine transport protein

Salmonella typhimurium

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	CHLORIDE ION × 2 SULFATE ION × 3 N-OCTANE × 1 PENTADECANE × 1 water × 1	与蛋白数一致
2	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	CHLORIDE ION × 2 SULFATE ION × 1 N-OCTANE × 1 PENTADECANE × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CLCA_SALTY
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–473； UniProt 1–473 作者链 B； PDB构建体 1–473； UniProt 1–473 作者链 C； PDB构建体 1–473； UniProt 1–473 作者链 D； PDB构建体 1–473； UniProt 1–473

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1kpl
沉积日期 deposition_date	2001-12-31
结构标题 title	Crystal Structure of the ClC Chloride Channel from S. typhimurium
关键词 keywords	helical membrane protein, homodimer, ion channel, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1kpl__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1kpl__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1kpl__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	29.07 Å
Rg（电子密度）	28.57 Å
总 Rg	29.23 Å
原子数	6612
残基数	881
排除体积	121300 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1kpl__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`1kpl__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	putative ClC family, chlorine transport protein
分子量 formula_weight	50499.6 kDa
突变 mutation	M26L/C264V
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	13216

MKTDTSTFLAQQIVRLRRRDQIRRLLQRDKTPLAILFMAAVVGTLTGLVGVAFEKAVSWVQNMRIGALVQVADHAFLLWPLAFILSALLAMVGYFLVRKFAPEAGGSGIPEIEGALEELRPVRWWRVLPVKFIGGMGTLGAGMVLGREGPTVQIGGNLGRMVLDVFRMRSAEARHTLLATGAAAGLSAAFNAPLAGILFIIEEMRPQFRYNLISIKAVFTGVIMSSIVFRIFNGEAPIIEVGKLSDAPVNTLWLYLILGIIFGVVGPVFNSLVLRTQDMFQRFHGGEIKKWVLMGGAIGGLCGILGLIEPAAAGGGFNLIPIAAAGNFSVGLLLFIFITRVVTTLLCFSSGAPGGIFAPMLALGTLLGTAFGMAAAVLFPQYHLEAGTFAIAGMGALMAASVRAPLTGIVLVLEMTDNYQLILPMIITCLGATLLAQFLGGKPLYSTILARTLAKQDAEQAEKNQNAPADENT

来源 Source

来源生物 organism	Salmonella typhimurium
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	602
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	N-OCTANE
分子量 formula_weight	114.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	PENTADECANE
分子量 formula_weight	212.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d1kpla_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.20 — Clc chloride channel
超家族 Superfamily superfamily	f.20.1 — Clc chloride channel
家族 Family family	f.20.1.1 — Clc chloride channel

结构域编号 domain_id	d1kplb_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.20 — Clc chloride channel
超家族 Superfamily superfamily	f.20.1 — Clc chloride channel
家族 Family family	f.20.1.1 — Clc chloride channel

结构域编号 domain_id	d1kplc_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.20 — Clc chloride channel
超家族 Superfamily superfamily	f.20.1 — Clc chloride channel
家族 Family family	f.20.1.1 — Clc chloride channel

结构域编号 domain_id	d1kpld_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.20 — Clc chloride channel
超家族 Superfamily superfamily	f.20.1 — Clc chloride channel
家族 Family family	f.20.1.1 — Clc chloride channel

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	1kplA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3080 — Clc chloride channel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Clc chloride channel

结构域编号 domain_id	1kplB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3080 — Clc chloride channel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Clc chloride channel

结构域编号 domain_id	1kplC00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3080 — Clc chloride channel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Clc chloride channel

结构域编号 domain_id	1kplD00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3080 — Clc chloride channel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Clc chloride channel

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晶胞边长 a length_a	185.719 Å
晶胞边长 b length_b	90.159 Å
晶胞边长 c length_c	80.753 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	98.95 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.000 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	0.2550
R_work r_work	0.2540
R_free r_free	0.2890

Crystal Structure of the ClC Chloride Channel from S. typhimurium

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

putative ClC family, chlorine transport protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1kpl__assembly_1__model_1

1kpl__assembly_1__model_1 | I(q)

1kpl__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal Structure of the ClC Chloride Channel from S. typhimurium

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

putative ClC family, chlorine transport protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1kpl__assembly_1__model_1

1kpl__assembly_1__model_1 | I(q)

1kpl__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)