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1l6t

STRUCTURE OF ALA24/ASP61 TO ASP24/ASN61 SUBSTITUTED SUBUNIT C OF ESCHERICHIA COLI ATP SYNTHASE

Method: SOLUTION NMR Dmax: 50.0 Å Quality: REASONABLE
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP SYNTHASE C CHAIN

Escherichia coli

UniProt P68699

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–79 突变：A24D, D61N 无其他共同聚合物 SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM NACL；压力 ATMOSPHERIC NMR样品组成：2.0 MM SUBUNIT C, 50 MM NACL, PH 5.0 | CDCl3:CD3OH:H20=4:4:1 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 1L6T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1A91 SUBUNIT C OF THE F1FO ATP SYNTHASE OF ESCHERICHIA COLI; NMR, 10 STRUCTURES 提交 1998-04-15 突变/修饰不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–79（79 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5；300 K
分辨率未提供
1ATY DETERMINATION OF LOCAL PROTEIN STRUCTURE BY SPIN LABEL DIFFERENCE 2D NMR: THE REGION NEIGHBORING ASP61 OF SUBUNIT C OF THE F1FO ATP SYNTHASE 提交 1994-10-05 突变/修饰不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–79（79 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
1C0V SUBUNIT C OF THE F1FO ATP SYNTHASE OF ESCHERICHIA COLI; NMR, 10 STRUCTURES 提交 1999-07-22 突变/修饰不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–79（79 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5；300 K；压力 1
NMR样品组成 4:4:1
分辨率未提供
1C17 A1C12 SUBCOMPLEX OF F1FO ATP SYNTHASE 提交 1999-07-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 A 1–79（79 aa）
链 B 1–79（79 aa）
链 C 1–79（79 aa）
链 D 1–79（79 aa）
链 E 1–79（79 aa）
链 F 1–79（79 aa）
链 G 1–79（79 aa）
链 H 1–79（79 aa）
链 I 1–79（79 aa）
链 J 1–79（79 aa）
链 K 1–79（79 aa）
链 L 1–79（79 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM；压力 AMBIENT
NMR测量条件 pH 8；300 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM；压力 AMBIENT
NMR样品组成 1 MM SUBUNIT C
分辨率未提供
1C99 ASP61 DEPROTONATED FORM OF SUBUNIT C OF THE F1FO ATP SYNTHASE OF ESCHERICHIA COLI 提交 1999-04-30 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–79（79 aa） 片段：subunit c
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 8；300 K
分辨率未提供
1IJP Solution Structure of Ala20Pro/Pro64Ala substituted subunit c of Escherichia coli ATP synthase 提交 2001-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–79（79 aa） 片段：subunit c
突变：A20P, P64A 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM NaCl；压力 atmospheric
NMR样品组成 2.2 mM subunit c, 50 mM NaCl, pH 5.0 | CDCl3:CD3OD:D2O=4:4:1 or CDCl3:CD3OH:H2O=4:4:1
分辨率未提供
4UTQ A structural model of the active ribosome-bound membrane protein insertase YidC 提交 2014-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Z 1–79（79 aa） 片段：MEMBRANE DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK IV,
分辨率 8.00 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ATPL_ECOLI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–79； UniProt 1–79

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1l6t

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1l6t
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1l6t
沉积日期 deposition_date2002-03-13
结构标题 titleSTRUCTURE OF ALA24/ASP61 TO ASP24/ASN61 SUBSTITUTED SUBUNIT C OF ESCHERICHIA COLI ATP SYNTHASE
关键词 keywordsTRANSMEMBRANE HELIX, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier18.33 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron18.56 Å
零角强度 I(0) i079141400.00
分子量 molecular_weight82801.0 kDa
排除体积 excluded_volume107220 ų
包络体积 envelope_volume19311 ų
水化壳体积 shell_volume9610 ų
包络直径 envelope_diameter70.2 Å
壳层 Rg shell_rg23.21 Å
包络 Rg envelope_rg20.63 Å
形状 Rg shape_rg18.53 Å
总 Rg total_rg18.88 Å
总原子数 total_atoms11970
残基数 n_residues790
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax50.0 Å
Rg (实空间) rg_real16.99 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.14 Å
I(0) (实空间) i0_real7.5600e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error7.8580e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal18.73 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal79140000.0000
解质量估计 total_estimate0.5984
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary13.5 Å
偏度 Skewness skewness0.433
峰度 Kurtosis kurtosis-0.756
角度范围 angular_range— – 0.4350 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha3.1110
最高正则化参数 α highest_alpha27130.0000
实空间数据点数 n_real_points75
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.001; Oscil: 0.845; Stabil: 0.962; Sysdev: 0.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.371; Smooth: 0.000
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1l6ta_
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamilyf.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family familyf.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id1l6tA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)