SAXSdb — 1lau

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (URACIL-DNA GLYCOSYLASE (E.C.3.2.2.-))

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	单体	蛋白 1 DNA 1	;DNA (5'-D(TPTP*T)-3') ; × 1 water × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	UNG_HHV11
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–244； UniProt 91–334

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1lau
沉积日期 deposition_date	1996-01-03
结构标题 title	URACIL-DNA GLYCOSYLASE
关键词 keywords	HYDROLASE, GLYCOSIDASE, DNA, HYDROLASE-DNA COMPLEX; HYDROLASE/DNA
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1lau__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1lau__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1lau__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	18.81 Å
Rg（电子密度）	17.51 Å
总 Rg	18.57 Å
原子数	1887
残基数	231
排除体积	33332 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1lau__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	;DNA (5'-D(TPTP*T)-3') ;
分子量 formula_weight	867.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	D
原子数 atom_count	2048

TTT

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	PROTEIN (URACIL-DNA GLYCOSYLASE (E.C.3.2.2.-))
分子量 formula_weight	27366.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MDLTNGGVSPAATSAPLDWTTFRRVFLIDDAWRPLMEPELANPLTAHLLAEYNRRCQTEEVLPPREDVFSWTRYCTPDEVRVVIIGQDPYHHPGQAHGLAFSVRANVPPPPSLRNVLAAVKNCYPEARMSGHGCLEKWARDGVLLLNTTLTVKRGAAASHSRIGWDRFVGGVIRRLAARRPGLVFMLWGTHAQNAIRPDPRVHCVLKFSHPSPLSKVPFGTCQHFLVANRYLETRSISPIDWSV

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	161

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d1laue_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.18 — Uracil-DNA glycosylase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.18.1 — Uracil-DNA glycosylase-like
家族 Family family	c.18.1.1 — Uracil-DNA glycosylase

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	1lauE00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	470 — Uracil-DNA Glycosylase, subunit E
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Uracil-DNA glycosylase-like domain

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晶胞边长 a length_a	46.660 Å
晶胞边长 b length_b	61.830 Å
晶胞边长 c length_c	86.670 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.800 Å
最低分辨率 resolution_low	8.000 Å
R 因子 r_factor	0.1740
R_work r_work	0.1740
R_free r_free	0.2250

URACIL-DNA GLYCOSYLASE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (URACIL-DNA GLYCOSYLASE (E.C.3.2.2.-))

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1lau__assembly_1__model_1

1lau__assembly_1__model_1 | I(q)

1lau__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (2)

URACIL-DNA GLYCOSYLASE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (URACIL-DNA GLYCOSYLASE (E.C.3.2.2.-))

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1lau__assembly_1__model_1

1lau__assembly_1__model_1 | I(q)

1lau__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (2)