1llc

STRUCTURE DETERMINATION OF THE ALLOSTERIC L-LACTATE DEHYDROGENASE FROM LACTOBACILLUS CASEI AT 3.0 ANGSTROMS RESOLUTION

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

L-LACTATE DEHYDROGENASE

Lactobacillus casei

UniProt P00343

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 4 1,6-di-O-phosphono-alpha-D-fructofuranose × 4 SULFATE ION × 4 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 4 1,6-di-O-phosphono-alpha-D-fructofuranose × 4 SULFATE ION × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 LDH_LACCA
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–325; UniProt 1–325

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1llc
沉积日期 deposition_date1988-11-21
结构标题 titleSTRUCTURE DETERMINATION OF THE ALLOSTERIC L-LACTATE DEHYDROGENASE FROM LACTOBACILLUS CASEI AT 3.0 ANGSTROMS RESOLUTION
关键词 keywordsOXIDOREDUCTASE(CHOH(D)-NAD(A)); OXIDOREDUCTASE(CHOH(D)-NAD(A))
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1llc__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1llc__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1llc__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)31.99 Å
Rg(电子密度)31.07 Å
总 Rg31.78 Å
原子数9916
残基数1284
排除体积177400 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1llc__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1llc__assembly_2__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd1llca1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamilyc.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family familyc.2.1.5 — LDH N-terminal domain-like
结构域编号 domain_idd1llca2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.162 — LDH C-terminal domain-like
超家族 Superfamily superfamilyd.162.1 — LDH C-terminal domain-like
家族 Family familyd.162.1.1 — Lactate & malate dehydrogenases, C-terminal domain

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id1llcA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain
结构域编号 domain_id1llcA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology110 — L-2-Hydroxyisocaproate Dehydrogenase; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Lactate dehydrogenase/glycoside hydrolase, family 4, C-terminal
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7. 引用文献 (4)