Staphylococcus aureus
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | FE (III) ION × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | FE (III) ION × 1 GLYCEROL × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | DEF_STAAU |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 12–194； UniProt 1–183 作者链 B； PDB构建体 12–194； UniProt 1–183 |
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| 条目编号 entry_id | 1lm4 |
| 沉积日期 deposition_date | 2002-04-30 |
| 结构标题 title | Structure of Peptide Deformylase from Staphylococcus aureus at 1.45 A |
| 关键词 keywords | PDF, Metalloenzyme, Staphylococcus aureus, HYDROLASE; HYDROLASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 17.42 Å |
| Rg（电子密度） | 16.23 Å |
| 总 Rg | 17.21 Å |
| 原子数 | 1463 |
| 残基数 | 183 |
| 排除体积 | 26036 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d1lm4a1 |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.167 — Peptide deformylase |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.167.1 — Peptide deformylase |
| 家族 Family family | d.167.1.1 — Peptide deformylase |
| 结构域编号 domain_id | d1lm4a2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | d1lm4b1 |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.167 — Peptide deformylase |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.167.1 — Peptide deformylase |
| 家族 Family family | d.167.1.1 — Peptide deformylase |
| 结构域编号 domain_id | d1lm4b2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | 1lm4A00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 90 — Alpha-Beta Complex |
| 拓扑 Topology topology | 45 — Peptide Deformylase |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Peptide deformylase |
| 结构域编号 domain_id | 1lm4B00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 90 — Alpha-Beta Complex |
| 拓扑 Topology topology | 45 — Peptide Deformylase |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Peptide deformylase |