SAXSdb — 1lon

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

adenylosuccinate synthetase

Mus musculus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	MAGNESIUM ION × 2 6-O-PHOSPHORYL INOSINE MONOPHOSPHATE × 2 HADACIDIN × 2 GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PURA1_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–457； UniProt 1–457

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1lon
沉积日期 deposition_date	2002-05-06
结构标题 title	Crystal Structure of the Recombinant Mouse-Muscle Adenylosuccinate Synthetase Complexed with 6-phosphoryl-IMP, GDP and Hadacidin
关键词 keywords	Purine biosynthesis, Ligase, GTP-binding; LIGASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1lon__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1lon__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1lon__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	27.54 Å
Rg（电子密度）	26.76 Å
总 Rg	27.51 Å
原子数	6834
残基数	862
排除体积	121290 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1lon__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	adenylosuccinate synthetase
分子量 formula_weight	50321.3 kDa
EC 编号 ec_number	6.3.4.4
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3603

MSGTRASNDRPPGTGGVKRGRLQQEAAATGSRVTVVLGAQWGDEGKGKVVDLLATDADIVSRCQGGNNAGHTVVVDGKEYDFHLLPSGIINTKAVSFIGNGVVIHLPGLFEEAEKNEKKGLKDWEKRLIISDRAHLVFDFHQAVDGLQEVQRQAQEGKNIGTTKKGIGPTYSSKAARTGLRICDLLSDFDEFSARFKNLAHQHQSMFPTLEIDVEGQLKRLKGFAERIRPMVRDGVYFMYEALHGPPKKVLVEGANAALLDIDFGTYPFVTSSNCTVGGVCTGLGIPPQNIGDVYGVVKAYTTRVGIGAFPTEQINEIGDLLQNRGHEWGVTTGRKRRCGWLDLMILRYAHMVNGFTALALTKLDILDVLSEIKVGISYKLNGKRIPYFPANQEILQKVEVEYETLPGWKADTTGARKWEDLPPQAQSYVRFVENHMGVAVKWVGVGKSRESMIQLF

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	house mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	6-O-PHOSPHORYL INOSINE MONOPHOSPHATE
分子量 formula_weight	428.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	HADACIDIN
分子量 formula_weight	119.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	443.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	186

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d1lona_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.10 — Nitrogenase iron protein-like

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	1lonA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	440 — Adenylosuccinate Synthetase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Adenylosuccinate Synthetase, subunit A, domain 1

结构域编号 domain_id	1lonA02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	300 — Adenylosuccinate Synthetase, subunit A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Adenylosuccinate Synthetase, subunit A, domain 2

结构域编号 domain_id	1lonA03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	170 — Adenylosuccinate Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Adenylosuccinate Synthetase, subunit A, domain 3

▶

晶胞边长 a length_a	70.780 Å
晶胞边长 b length_b	70.780 Å
晶胞边长 c length_c	195.630 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 43 21 2
空间群编号 int_tables_number	96
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.100 Å
最低分辨率 resolution_low	10.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2240
R_free r_free	0.2710

Crystal Structure of the Recombinant Mouse-Muscle Adenylosuccinate Synthetase Complexed with 6-phosphoryl-IMP, GDP and Hadacidin

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

adenylosuccinate synthetase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1lon__assembly_1__model_1

1lon__assembly_1__model_1 | I(q)

1lon__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal Structure of the Recombinant Mouse-Muscle Adenylosuccinate Synthetase Complexed with 6-phosphoryl-IMP, GDP and Hadacidin

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

adenylosuccinate synthetase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1lon__assembly_1__model_1

1lon__assembly_1__model_1 | I(q)

1lon__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)