Plasmodium falciparum
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Pepstatin × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Pepstatin × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| 3 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 8 | Pepstatin × 4 water × 4 | 与蛋白数一致 |
| 4 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 4 | Pepstatin × 2 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | Q8IM16_PLAF7 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–328； UniProt 122–449 作者链 B； PDB构建体 1–328； UniProt 122–449 |
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| 条目编号 entry_id | 1ls5 |
| 沉积日期 deposition_date | 2002-05-16 |
| 结构标题 title | Crystal structure of plasmepsin IV from P. falciparum in complex with pepstatin A |
| 关键词 keywords | EUKARYOTIC ASPARTIC PROTEINASE, HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR complex; HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 4 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 27.60 Å |
| Rg（电子密度） | 26.37 Å |
| 总 Rg | 27.19 Å |
| 原子数 | 5314 |
| 残基数 | 662 |
| 排除体积 | 95125 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 1ls5__assembly_1__model_1 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 2 | 1 | 1ls5__assembly_2__model_1 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 3 | 1 | 1ls5__assembly_3__model_1 |
octameric （8） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 4 | 1 | 1ls5__assembly_4__model_1 |
tetrameric （4） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 结构域编号 domain_id | d1ls5a_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.50 — Acid proteases |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.50.1 — Acid proteases |
| 家族 Family family | b.50.1.2 — Pepsin-like |
| 结构域编号 domain_id | d1ls5b_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.50 — Acid proteases |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.50.1 — Acid proteases |
| 家族 Family family | b.50.1.2 — Pepsin-like |
| 结构域编号 domain_id | 1ls5A01 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Cathepsin D, subunit A; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Acid Proteases |
| 结构域编号 domain_id | 1ls5A02 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Cathepsin D, subunit A; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Acid Proteases |
| 结构域编号 domain_id | 1ls5B01 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Cathepsin D, subunit A; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Acid Proteases |
| 结构域编号 domain_id | 1ls5B02 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Cathepsin D, subunit A; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Acid Proteases |