1m4x
PBCV-1 virus capsid, quasi-atomic model
1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures
当前条目没有可用的 UniProt 蛋白身份。
七张关系表仍保留该条目的 assembly 与组成信息,但缺少统一蛋白身份时,不能可靠建立跨 PDB 的同蛋白链接。
当前条目的 assembly 组成
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 蛋白 / DNA / RNA / 其他聚合物 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 5040 / 0 / 0 / 0 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 84 / 0 / 0 / 0 | 与蛋白数一致 |
| 3 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 420 / 0 / 0 / 0 | 与蛋白数一致 |
| 4 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 504 / 0 / 0 / 0 | 与蛋白数一致 |
| 5 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 90 / 0 / 0 / 0 | 与蛋白数一致 |
| 6 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 198 / 0 / 0 / 0 | 与蛋白数一致 |
| 7 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 84 / 0 / 0 / 0 | 与蛋白数一致 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。
2. 结构基本信息 2. Structure Basics
| 条目编号 entry_id | 1m4x |
| 沉积日期 deposition_date | 2002-07-05 |
| 结构标题 title | PBCV-1 virus capsid, quasi-atomic model |
| 关键词 keywords | icosahedral virus capsid, beta barrel, Icosahedral virus, Virus; VIRUS |
| 实验方法 method | ELECTRON MICROSCOPY |
3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
1m4x__assembly_1__model_1
Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
1m4x__assembly_1__model_1 | I(q)
1m4x__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending
| Rg(Guinier) | 0.00 Å |
| Rg(电子密度) | 812.50 Å |
| 总 Rg | 812.60 Å |
| 原子数 | 581580 |
| 残基数 | 74340 |
| 排除体积 | 10284000 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 1m4x__assembly_1__model_1 |
complete icosahedral assembly (5040) | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 2 | 1 | 1m4x__assembly_2__model_1 |
84-meric (84) | 排除 | — | — |
| 排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。 | ||||||
| 3 | 1 | 1m4x__assembly_3__model_1 |
420-meric (420) | 排除 | — | — |
| 排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。 | ||||||
| 4 | 1 | 1m4x__assembly_4__model_1 |
504-meric (504) | 排除 | — | — |
| 排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。 | ||||||
| 5 | 1 | 1m4x__assembly_5__model_1 |
90-meric (90) | 排除 | — | — |
| 排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。 | ||||||
| 6 | 1 | 1m4x__assembly_6__model_1 |
198-meric (198) | 排除 | — | — |
| 排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。 | ||||||
| 7 | 1 | 1m4x__assembly_7__model_1 |
84-meric (84) | 排除 | — | — |
| 排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。 | ||||||
4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment
5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)
6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains
SCOP 2.08 (3 domains)
| 结构域编号 domain_id | d1m4xa_ |
| 类 Class class | i — Low resolution protein structures |
| 折叠类型 Fold fold | i.6 — Viruses and virus-receptor complexes |
| 超家族 Superfamily superfamily | i.6.1 — Viruses and virus-receptor complexes |
| 家族 Family family | i.6.1.1 — Viruses and virus-receptor complexes |
| 结构域编号 domain_id | d1m4xb_ |
| 类 Class class | i — Low resolution protein structures |
| 折叠类型 Fold fold | i.6 — Viruses and virus-receptor complexes |
| 超家族 Superfamily superfamily | i.6.1 — Viruses and virus-receptor complexes |
| 家族 Family family | i.6.1.1 — Viruses and virus-receptor complexes |
| 结构域编号 domain_id | d1m4xc_ |
| 类 Class class | i — Low resolution protein structures |
| 折叠类型 Fold fold | i.6 — Viruses and virus-receptor complexes |
| 超家族 Superfamily superfamily | i.6.1 — Viruses and virus-receptor complexes |
| 家族 Family family | i.6.1.1 — Viruses and virus-receptor complexes |