1m72

Crystal Structure of Caspase-1 from Spodoptera frugiperda

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Caspase-1

Spodoptera frugiperda

UniProt P89116

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Ace-Asp-Glu-Val-Asp-chloromethylketone × 2 1,2-ETHANEDIOL × 4 water × 4 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Ace-Asp-Glu-Val-Asp-chloromethylketone × 2 1,2-ETHANEDIOL × 8 water × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ICE1_SPOFR
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–271; UniProt 29–299 作者链 B; PDB构建体 1–271; UniProt 29–299 作者链 C; PDB构建体 1–271; UniProt 29–299

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1m72
沉积日期 deposition_date2002-07-18
结构标题 titleCrystal Structure of Caspase-1 from Spodoptera frugiperda
关键词 keywordsCASPASE, CYSTEINE PROTEASE, HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR COMPLEX; HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1m72__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1m72__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1m72__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)23.73 Å
Rg(电子密度)22.26 Å
总 Rg23.16 Å
原子数4047
残基数503
排除体积72088 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1m72__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1m72__assembly_2__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd1m72a_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.17 — Caspase-like
超家族 Superfamily superfamilyc.17.1 — Caspase-like
家族 Family familyc.17.1.1 — Caspase catalytic domain
结构域编号 domain_idd1m72b_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.17 — Caspase-like
超家族 Superfamily superfamilyc.17.1 — Caspase-like
家族 Family familyc.17.1.1 — Caspase catalytic domain
结构域编号 domain_idd1m72c1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.17 — Caspase-like
超家族 Superfamily superfamilyc.17.1 — Caspase-like
家族 Family familyc.17.1.1 — Caspase catalytic domain
结构域编号 domain_idd1m72c2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id1m72A00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1460 —
结构域编号 domain_id1m72B00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1460 —
结构域编号 domain_id1m72C00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1460 —
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7. 引用文献 (1)