Pseudomonas putida
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 8 | MAGNESIUM ION × 8 ATROLACTIC ACID (2-PHENYL-LACTIC ACID) × 8 water × 8 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | MANR_PSEPU |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–359； UniProt 1–359 |
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| 条目编号 entry_id | 1mdr |
| 沉积日期 deposition_date | 1993-11-19 |
| 结构标题 title | THE ROLE OF LYSINE 166 IN THE MECHANISM OF MANDELATE RACEMASE FROM PSEUDOMONAS PUTIDA: MECHANISTIC AND CRYSTALLOGRAPHIC EVIDENCE FOR STEREOSPECIFIC ALKYLATION BY (R)-ALPHA-PHENYLGLYCIDATE |
| 关键词 keywords | RACEMASE; RACEMASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 40.69 Å |
| Rg（电子密度） | 40.19 Å |
| 总 Rg | 40.65 Å |
| 原子数 | 21688 |
| 残基数 | 2856 |
| 排除体积 | 390370 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d1mdra1 |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.1 — TIM beta/alpha-barrel |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.1.11 — Enolase C-terminal domain-like |
| 家族 Family family | c.1.11.2 — D-glucarate dehydratase-like |
| 结构域编号 domain_id | d1mdra2 |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.54 — Enolase N-terminal domain-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.54.1 — Enolase N-terminal domain-like |
| 家族 Family family | d.54.1.1 — Enolase N-terminal domain-like |
| 结构域编号 domain_id | 1mdrA01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 390 — Enolase-like; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Enolase-like, N-terminal domain |
| 结构域编号 domain_id | 1mdrA02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Alpha-Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 20 — TIM Barrel |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 120 — Enolase-like C-terminal domain |