1n0e

CRYSTAL STRUCTURE OF A CELL DIVISION AND CELL WALL BIOSYNTHESIS PROTEIN UPF0040 FROM MYCOPLASMA PNEUMONIAE: INDICATION OF A NOVEL FOLD WITH A POSSIBLE NEW CONSERVED SEQUENCE MOTIF

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein mraZ

Mycoplasma pneumoniae

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 8	water × 8	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MRAZ_MYCPN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 26–166； UniProt 1–141 作者链 B； PDB构建体 26–166； UniProt 1–141 作者链 C； PDB构建体 26–166； UniProt 1–141 作者链 D； PDB构建体 26–166； UniProt 1–141 作者链 E； PDB构建体 26–166； UniProt 1–141 作者链 F； PDB构建体 26–166； UniProt 1–141 作者链 G； PDB构建体 26–166； UniProt 1–141 作者链 H； PDB构建体 26–166； UniProt 1–141

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1n0e
沉积日期 deposition_date	2002-10-13
结构标题 title	CRYSTAL STRUCTURE OF A CELL DIVISION AND CELL WALL BIOSYNTHESIS PROTEIN UPF0040 FROM MYCOPLASMA PNEUMONIAE: INDICATION OF A NOVEL FOLD WITH A POSSIBLE NEW CONSERVED SEQUENCE MOTIF
关键词 keywords	;Cell Division and cell wall biosynthesis protein, Structural Genomics, BSGC structure funded by NIH, Protein Structure Initiative, PSI, Berkeley Structural Genomics Center, BIOSYNTHETIC PROTEIN ;; BIOSYNTHETIC PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1n0e__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1n0e__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1n0e__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	38.43 Å
Rg（电子密度）	37.72 Å
总 Rg	38.47 Å
原子数	9238
残基数	1130
排除体积	165090 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1n0e__assembly_1__model_1`	octameric （8）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 21 domains

SCOP 2.08 (13 domains)

结构域编号 domain_id	d1n0ea1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.129 — Double-split beta-barrel
超家族 Superfamily superfamily	b.129.1 — AbrB/MazE/MraZ-like
家族 Family family	b.129.1.2 — Hypothetical protein MraZ

结构域编号 domain_id	d1n0ea2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d1n0eb1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.129 — Double-split beta-barrel
超家族 Superfamily superfamily	b.129.1 — AbrB/MazE/MraZ-like
家族 Family family	b.129.1.2 — Hypothetical protein MraZ

结构域编号 domain_id	d1n0eb2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d1n0ec_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.129 — Double-split beta-barrel
超家族 Superfamily superfamily	b.129.1 — AbrB/MazE/MraZ-like
家族 Family family	b.129.1.2 — Hypothetical protein MraZ

结构域编号 domain_id	d1n0ed_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.129 — Double-split beta-barrel
超家族 Superfamily superfamily	b.129.1 — AbrB/MazE/MraZ-like
家族 Family family	b.129.1.2 — Hypothetical protein MraZ

结构域编号 domain_id	d1n0ee1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.129 — Double-split beta-barrel
超家族 Superfamily superfamily	b.129.1 — AbrB/MazE/MraZ-like
家族 Family family	b.129.1.2 — Hypothetical protein MraZ

结构域编号 domain_id	d1n0ee2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d1n0ef1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.129 — Double-split beta-barrel
超家族 Superfamily superfamily	b.129.1 — AbrB/MazE/MraZ-like
家族 Family family	b.129.1.2 — Hypothetical protein MraZ

结构域编号 domain_id	d1n0ef2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d1n0eg1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.129 — Double-split beta-barrel
超家族 Superfamily superfamily	b.129.1 — AbrB/MazE/MraZ-like
家族 Family family	b.129.1.2 — Hypothetical protein MraZ

结构域编号 domain_id	d1n0eg2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d1n0eh_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.129 — Double-split beta-barrel
超家族 Superfamily superfamily	b.129.1 — AbrB/MazE/MraZ-like
家族 Family family	b.129.1.2 — Hypothetical protein MraZ

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	1n0eA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1550 — Chemotaxis protein chec
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Transcriptional regulator MraZ domain

结构域编号 domain_id	1n0eB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1550 — Chemotaxis protein chec
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Transcriptional regulator MraZ domain

结构域编号 domain_id	1n0eC00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1550 — Chemotaxis protein chec
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Transcriptional regulator MraZ domain

结构域编号 domain_id	1n0eD00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1550 — Chemotaxis protein chec
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Transcriptional regulator MraZ domain

结构域编号 domain_id	1n0eE00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1550 — Chemotaxis protein chec
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Transcriptional regulator MraZ domain

结构域编号 domain_id	1n0eF00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1550 — Chemotaxis protein chec
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Transcriptional regulator MraZ domain

结构域编号 domain_id	1n0eG00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1550 — Chemotaxis protein chec
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Transcriptional regulator MraZ domain

结构域编号 domain_id	1n0eH00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1550 — Chemotaxis protein chec
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Transcriptional regulator MraZ domain

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晶胞边长 a length_a	78.627 Å
晶胞边长 b length_b	100.064 Å
晶胞边长 c length_c	100.851 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	93.30 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.700 Å
最低分辨率 resolution_low	14.970 Å
R 因子 r_factor	0.2310
R_work r_work	0.2310
R_free r_free	0.2790

描述 description	Protein mraZ
分子量 formula_weight	19342.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H
原子数 atom_count	9772

CRYSTAL STRUCTURE OF A CELL DIVISION AND CELL WALL BIOSYNTHESIS PROTEIN UPF0040 FROM MYCOPLASMA PNEUMONIAE: INDICATION OF A NOVEL FOLD WITH A POSSIBLE NEW CONSERVED SEQUENCE MOTIF

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein mraZ

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1n0e__assembly_1__model_1

1n0e__assembly_1__model_1 | I(q)

1n0e__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 21 domains

SCOP 2.08 (13 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)

来源生物 organism	Mycoplasma pneumoniae
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	2104
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	534

CRYSTAL STRUCTURE OF A CELL DIVISION AND CELL WALL BIOSYNTHESIS PROTEIN UPF0040 FROM MYCOPLASMA PNEUMONIAE: INDICATION OF A NOVEL FOLD WITH A POSSIBLE NEW CONSERVED SEQUENCE MOTIF

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein mraZ

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1n0e__assembly_1__model_1

1n0e__assembly_1__model_1 | I(q)

1n0e__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 21 domains

SCOP 2.08 (13 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)