1n10

Crystal Structure of Phl p 1, a Major Timothy Grass Pollen Allergen

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Pollen allergen Phl p 1

Phleum pratense

UniProt P43213

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 蛋白 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MPAP1_PHLPR
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–241; UniProt 23–263 作者链 B; PDB构建体 1–241; UniProt 23–263

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1n10
沉积日期 deposition_date2002-10-16
结构标题 titleCrystal Structure of Phl p 1, a Major Timothy Grass Pollen Allergen
关键词 keywords;Plant allergen, phl p 1, expansin, immunoglobulin-like fold, double-psi beta barrel, Structural Genomics, Protein Structure Initiative, New York SGX Research Center for Structural Genomics, NYSGXRC, ALLERGEN ;; ALLERGEN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1n10__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1n10__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1n10__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)20.48 Å
Rg(电子密度)20.00 Å
总 Rg20.89 Å
原子数1770
残基数228
排除体积31356 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1n10__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1n10__assembly_2__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd1n10a1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.7 — C2 domain-like
超家族 Superfamily superfamilyb.7.3 — PHL pollen allergen
家族 Family familyb.7.3.1 — PHL pollen allergen
结构域编号 domain_idd1n10a2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.52 — Double psi beta-barrel
超家族 Superfamily superfamilyb.52.1 — Barwin-like endoglucanases
家族 Family familyb.52.1.3 — Pollen allergen PHL P 1 N-terminal domain
结构域编号 domain_idd1n10b1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.7 — C2 domain-like
超家族 Superfamily superfamilyb.7.3 — PHL pollen allergen
家族 Family familyb.7.3.1 — PHL pollen allergen
结构域编号 domain_idd1n10b2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.52 — Double psi beta-barrel
超家族 Superfamily superfamilyb.52.1 — Barwin-like endoglucanases
家族 Family familyb.52.1.3 — Pollen allergen PHL P 1 N-terminal domain

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1n10A01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology40 — Barwin-like endoglucanases
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — RlpA-like domain
结构域编号 domain_id1n10A02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily760 — Expansin, cellulose-binding-like domain
结构域编号 domain_id1n10B01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology40 — Barwin-like endoglucanases
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — RlpA-like domain
结构域编号 domain_id1n10B02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily760 — Expansin, cellulose-binding-like domain
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7. 引用文献 (3)