Drosophila melanogaster
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 单体 | 蛋白 1 DNA 2 | ;DNA (5'-D(*TP*GP*TP*GP*TP*CP*AP*AP*GP*TP*GP*GP*CP*TP*GP*T)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(*AP*CP*AP*GP*CP*CP*AP*CP*TP*TP*GP*AP*CP*AP*CP*A)-3') ; × 1 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | VND_DROME |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 3 |
| 链与序列区间 | 作者链 P； PDB构建体 8–70； UniProt 68–130 |
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| 条目编号 entry_id | 1nk3 |
| 沉积日期 deposition_date | 1998-05-06 |
| 结构标题 title | VND/NK-2 HOMEODOMAIN/DNA COMPLEX, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE |
| 关键词 keywords | HOMEODOMAIN, HOMEOBOX, DNA-BINDING PROTEIN, EMBRYONIC DEVELOPMENT, COMPLEX (HOMEODOMAIN-DNA), DNA BINDING PROTEIN-DNA COMPLEX; DNA BINDING PROTEIN/DNA |
| 实验方法 method | SOLUTION NMR |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 17.68 Å |
| Rg（电子密度） | 16.73 Å |
| 总 Rg | 17.59 Å |
| 原子数 | 2160 |
| 残基数 | 95 |
| 排除体积 | 19465 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d1nk3p_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.4.1 — Homeodomain-like |
| 家族 Family family | a.4.1.1 — Homeodomain |
| 结构域编号 domain_id | 1nk3P00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 10 — Arc Repressor Mutant, subunit A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 60 — Homeodomain-like |