1nvo
Solution structure of a four-helix bundle model, apo-DF1
1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures
当前条目没有可用的 UniProt 蛋白身份。
七张关系表仍保留该条目的 assembly 与组成信息，但缺少统一蛋白身份时，不能可靠建立跨 PDB 的同蛋白链接。
当前条目的 assembly 组成
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 蛋白 / DNA / RNA / 其他聚合物 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 2 / 0 / 0 / 0 | 与蛋白数一致 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
2. 结构基本信息 2. Structure Basics
| 条目编号 entry_id | 1nvo |
| 沉积日期 deposition_date | 2003-02-04 |
| 结构标题 title | Solution structure of a four-helix bundle model, apo-DF1 |
| 关键词 keywords | De Novo Protein Design, Alpha-Helical Bundle, Diiron Protein Model, UNKNOWN FUNCTION; UNKNOWN FUNCTION |
| 实验方法 method | SOLUTION NMR |
3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
1nvo__assembly_1__model_12
Assembly 1 · Model 12 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
1nvo__assembly_1__model_12 | I(q)
1nvo__assembly_1__model_12 | P(r) · Pending
| Rg（Guinier） | 14.70 Å |
| Rg（电子密度） | 13.62 Å |
| 总 Rg | 15.09 Å |
| 原子数 | 1712 |
| 残基数 | 96 |
| 排除体积 | 15282 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 1nvo__assembly_1__model_1 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 2 | 1nvo__assembly_1__model_2 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 3 | 1nvo__assembly_1__model_3 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 4 | 1nvo__assembly_1__model_4 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 5 | 1nvo__assembly_1__model_5 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 6 | 1nvo__assembly_1__model_6 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 7 | 1nvo__assembly_1__model_7 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 8 | 1nvo__assembly_1__model_8 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 9 | 1nvo__assembly_1__model_9 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 10 | 1nvo__assembly_1__model_10 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 11 | 1nvo__assembly_1__model_11 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 12 | 1nvo__assembly_1__model_12 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 13 | 1nvo__assembly_1__model_13 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 14 | 1nvo__assembly_1__model_14 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment
5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)
6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains
SCOP 2.08 (2 domains)
| 结构域编号 domain_id | d1nvoa_ |
| 类 Class class | k — Designed proteins |
| 折叠类型 Fold fold | k.8 — Designed four-helix bundle protein |
| 超家族 Superfamily superfamily | k.8.1 — Designed four-helix bundle protein |
| 家族 Family family | k.8.1.1 — Designed four-helix bundle protein |
| 结构域编号 domain_id | d1nvob_ |
| 类 Class class | k — Designed proteins |
| 折叠类型 Fold fold | k.8 — Designed four-helix bundle protein |
| 超家族 Superfamily superfamily | k.8.1 — Designed four-helix bundle protein |
| 家族 Family family | k.8.1.1 — Designed four-helix bundle protein |
CATH v4.4 (2 domains)
| 结构域编号 domain_id | 1nvoA00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 420 — Immunoglobulin FC, subunit C |
| 结构域编号 domain_id | 1nvoB00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 420 — Immunoglobulin FC, subunit C |