Thermotoga maritima
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | SODIUM ION × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | Q9X1V6_THEMA |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 14–234； UniProt 2–222 |
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| 条目编号 entry_id | 1o1z |
| 沉积日期 deposition_date | 2003-02-12 |
| 结构标题 title | Crystal structure of glycerophosphodiester phosphodiesterase (GDPD) (TM1621) from Thermotoga maritima at 1.60 A resolution |
| 关键词 keywords | ;TM1621, GLYCEROPHOSPHODIESTER PHOSPHODIESTERASE (GDPD), STRUCTURAL GENOMICS, JCSG, PSI, Protein Structure Initiative, Joint Center for Structural Genomics, HYDROLASE ;; HYDROLASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 18.81 Å |
| Rg（电子密度） | 17.61 Å |
| 总 Rg | 18.69 Å |
| 原子数 | 1832 |
| 残基数 | 226 |
| 排除体积 | 32875 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d1o1za1 |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.1 — TIM beta/alpha-barrel |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.1.18 — PLC-like phosphodiesterases |
| 家族 Family family | c.1.18.3 — Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase |
| 结构域编号 domain_id | d1o1za2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | 1o1zA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Alpha-Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 20 — TIM Barrel |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 190 — Phosphatidylinositol (PI) phosphodiesterase |