1o6u

The Crystal Structure of Human Supernatant Protein Factor

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

SEC14-LIKE PROTEIN 2

HOMO SAPIENS

UniProt O76054

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 PALMITIC ACID × 1 water × 1 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 蛋白 1 PALMITIC ACID × 1 water × 1 与蛋白数一致
3 蛋白单体 单体 蛋白 1 PALMITIC ACID × 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 S142_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 C; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 E; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1o6u
沉积日期 deposition_date2002-10-16
结构标题 titleThe Crystal Structure of Human Supernatant Protein Factor
关键词 keywordsLIPID TRANSFER, CRAL_TRIO, LIPID BINDING, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1o6u__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1o6u__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1o6u__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)25.37 Å
Rg(电子密度)24.32 Å
总 Rg25.02 Å
原子数3142
残基数377
排除体积56568 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1o6u__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1o6u__assembly_2__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 1o6u__assembly_3__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 15 domains

SCOP 2.08 (9 domains)

结构域编号 domain_idd1o6ua1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.5 — RuvA C-terminal domain-like
超家族 Superfamily superfamilya.5.3 — CRAL/TRIO N-terminal domain
家族 Family familya.5.3.1 — CRAL/TRIO N-terminal domain
结构域编号 domain_idd1o6ua2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.132 — Supernatant protein factor (SPF), C-terminal domain
超家族 Superfamily superfamilyb.132.1 — Supernatant protein factor (SPF), C-terminal domain
家族 Family familyb.132.1.1 — Supernatant protein factor (SPF), C-terminal domain
结构域编号 domain_idd1o6ua3
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.13 — SpoIIaa-like
超家族 Superfamily superfamilyc.13.1 — CRAL/TRIO domain
家族 Family familyc.13.1.1 — CRAL/TRIO domain
结构域编号 domain_idd1o6uc1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.5 — RuvA C-terminal domain-like
超家族 Superfamily superfamilya.5.3 — CRAL/TRIO N-terminal domain
家族 Family familya.5.3.1 — CRAL/TRIO N-terminal domain
结构域编号 domain_idd1o6uc2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.132 — Supernatant protein factor (SPF), C-terminal domain
超家族 Superfamily superfamilyb.132.1 — Supernatant protein factor (SPF), C-terminal domain
家族 Family familyb.132.1.1 — Supernatant protein factor (SPF), C-terminal domain
结构域编号 domain_idd1o6uc3
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.13 — SpoIIaa-like
超家族 Superfamily superfamilyc.13.1 — CRAL/TRIO domain
家族 Family familyc.13.1.1 — CRAL/TRIO domain
结构域编号 domain_idd1o6ue1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.5 — RuvA C-terminal domain-like
超家族 Superfamily superfamilya.5.3 — CRAL/TRIO N-terminal domain
家族 Family familya.5.3.1 — CRAL/TRIO N-terminal domain
结构域编号 domain_idd1o6ue2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.132 — Supernatant protein factor (SPF), C-terminal domain
超家族 Superfamily superfamilyb.132.1 — Supernatant protein factor (SPF), C-terminal domain
家族 Family familyb.132.1.1 — Supernatant protein factor (SPF), C-terminal domain
结构域编号 domain_idd1o6ue3
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.13 — SpoIIaa-like
超家族 Superfamily superfamilyc.13.1 — CRAL/TRIO domain
家族 Family familyc.13.1.1 — CRAL/TRIO domain

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id1o6uA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology525 — Phosphatidylinositol Transfer Protein Sec14p
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CRAL-TRIO lipid binding domain
结构域编号 domain_id1o6uA02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily680 — GOLD domain
结构域编号 domain_id1o6uC01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology525 — Phosphatidylinositol Transfer Protein Sec14p
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CRAL-TRIO lipid binding domain
结构域编号 domain_id1o6uC02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily680 — GOLD domain
结构域编号 domain_id1o6uE01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology525 — Phosphatidylinositol Transfer Protein Sec14p
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CRAL-TRIO lipid binding domain
结构域编号 domain_id1o6uE02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily680 — GOLD domain
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7. 引用文献 (1)