MUS MUSCULUS
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 单体 | 蛋白 1 DNA 2 | ;5'-D(*CP*GP*AP*TP*GP*CP*GP*GP*GP*TP *GP*CP*A)-3' ; × 1 ;5'-D(*TP*GP*CP*AP*CP*CP*CP*GP*CP*AP *TP*CP*G)-3' ; × 1 ZINC ION × 2 water × 2 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | P70348 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–174； UniProt 1–174 |
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| 条目编号 entry_id | 1odh |
| 沉积日期 deposition_date | 2003-02-19 |
| 结构标题 title | Structure of the GCM domain bound to DNA |
| 关键词 keywords | TRANSCRIPTION FACTOR/DNA, TRANSCRIPTION FACTOR, DNA-BINDING DOMAIN, PROTEIN-DNA COMPLEX, TRANSCRIPTION FACTOR-DNA complex; TRANSCRIPTION FACTOR/DNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 19.14 Å |
| Rg（电子密度） | 18.33 Å |
| 总 Rg | 19.24 Å |
| 原子数 | 1806 |
| 残基数 | 184 |
| 排除体积 | 30001 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d1odha_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.239 — GCM domain |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.239.1 — GCM domain |
| 家族 Family family | d.239.1.1 — GCM domain |
| 结构域编号 domain_id | 1odhA01 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Single Sheet |
| 拓扑 Topology topology | 25 — N-terminal domain of TfIIb |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 670 — GCM domain, large subdomain |
| 结构域编号 domain_id | 1odhA02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Alpha-Beta Plaits |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 3530 — GCM motif |