AMYCOLATOPSIS ORIENTALIS
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 2 | GLYCEROL × 4 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | O52806 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–205； UniProt 1–205 作者链 B； PDB构建体 1–205； UniProt 1–205 |
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| 条目编号 entry_id | 1ofn |
| 沉积日期 deposition_date | 2003-04-17 |
| 结构标题 title | Purification, crystallisation and preliminary structural studies of dTDP-4-keto-6-deoxy-glucose-5-epimerase (EvaD) from Amycolatopsis orientalis; the fourth enzyme in the dTDP-L-epivancosamine biosynthetic pathway. |
| 关键词 keywords | EPIMERASE, VANCOMYCIN GROUP ANTIBIOTIC, EVAD, ISOMERASE; ISOMERASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 22.44 Å |
| Rg（电子密度） | 21.52 Å |
| 总 Rg | 22.35 Å |
| 原子数 | 3147 |
| 残基数 | 405 |
| 排除体积 | 56182 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d1ofna_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.82 — Double-stranded beta-helix |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.82.1 — RmlC-like cupins |
| 家族 Family family | b.82.1.1 — dTDP-sugar isomerase |
| 结构域编号 domain_id | d1ofnb_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.82 — Double-stranded beta-helix |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.82.1 — RmlC-like cupins |
| 家族 Family family | b.82.1.1 — dTDP-sugar isomerase |
| 结构域编号 domain_id | 1ofnA00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 120 — Jelly Rolls |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Jelly Rolls |
| 结构域编号 domain_id | 1ofnB00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 120 — Jelly Rolls |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Jelly Rolls |