SAXSdb — 1ohz

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CELLULOSOMAL SCAFFOLDING PROTEIN A

CLOSTRIDIUM THERMOCELLUM

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	ENDO-1,4-BETA-XYLANASE Y × 3 （P51584） NITRATE ION × 6 1,2-ETHANEDIOL × 3 CALCIUM ION × 6 CHLORIDE ION × 3 water × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CIPA_CLOTM
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–162； UniProt 181–340

ENDO-1,4-BETA-XYLANASE Y

CLOSTRIDIUM THERMOCELLUM

UniProt P51584

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	CELLULOSOMAL SCAFFOLDING PROTEIN A × 3 （Q06851） NITRATE ION × 6 1,2-ETHANEDIOL × 3 CALCIUM ION × 6 CHLORIDE ION × 3 water × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	XYNY_CLOTM
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 2–60； UniProt 733–791

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1ohz
沉积日期 deposition_date	2003-06-04
结构标题 title	Cohesin-Dockerin complex from the cellulosome of Clostridium thermocellum
关键词 keywords	CELL ADHESION, COHESIN-DOCKERIN COMPLEX, COHESIN, DOCKERIN, CELLULOSOME, CLOSTRIDIUM THERMOCELLUM, CELLULOSE DEGRADATION; CELL ADHESION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1ohz__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1ohz__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1ohz__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	26.16 Å
Rg（电子密度）	25.20 Å
总 Rg	25.92 Å
原子数	4374
残基数	588
排除体积	77941 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1ohz__assembly_1__model_1`	hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	CELLULOSOMAL SCAFFOLDING PROTEIN A
分子量 formula_weight	17027.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	1573

MASDGVVVEIGKVTGSVGTTVEIPVYFRGVPSKGIANCDFVFRYDPNVLEIIGIDPGDIIVDPNPTKSFDTAIYPDRKIIVFLFAEDSGTGAYAITKDGVFAKIRATVKSSAPGYITFDEVGGFADNDLVEQKVSFIDGGVNVGNATPTKGATPTNTATPTK

来源 Source

来源生物 organism	CLOSTRIDIUM THERMOCELLUM
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1515
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	ENDO-1,4-BETA-XYLANASE Y
分子量 formula_weight	6515.4 kDa
EC 编号 ec_number	3.2.1.8
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MGDVNGDGTINSTDLTMLKRSVLRAITLTDDAKARADVDKNGSINSTDVLLLSRYLLRVI

来源 Source

来源生物 organism	CLOSTRIDIUM THERMOCELLUM
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1515
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	NITRATE ION
分子量 formula_weight	62.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	115

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d1ohza_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.2 — Common fold of diphtheria toxin/transcription factors/cytochrome f
超家族 Superfamily superfamily	b.2.2 — Carbohydrate-binding domain
家族 Family family	b.2.2.2 — Cellulose-binding domain family III

结构域编号 domain_id	d1ohzb_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.139 — Type I dockerin domain
超家族 Superfamily superfamily	a.139.1 — Type I dockerin domain
家族 Family family	a.139.1.1 — Type I dockerin domain

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	1ohzA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	680 —

结构域编号 domain_id	1ohzB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1330 — Type 1 dockerin domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dockerin domain

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晶胞边长 a length_a	97.906 Å
晶胞边长 b length_b	97.906 Å
晶胞边长 c length_c	97.906 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 21 3
空间群编号 int_tables_number	198
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.200 Å
最低分辨率 resolution_low	17.000 Å
R 因子 r_factor	0.2113
R_work r_work	0.2097
R_free r_free	0.2417

Cohesin-Dockerin complex from the cellulosome of Clostridium thermocellum

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CELLULOSOMAL SCAFFOLDING PROTEIN A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

ENDO-1,4-BETA-XYLANASE Y

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1ohz__assembly_1__model_1

1ohz__assembly_1__model_1 | I(q)

1ohz__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)

Cohesin-Dockerin complex from the cellulosome of Clostridium thermocellum

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CELLULOSOMAL SCAFFOLDING PROTEIN A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ENDO-1,4-BETA-XYLANASE Y

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1ohz__assembly_1__model_1

1ohz__assembly_1__model_1 | I(q)

1ohz__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)