1oql

Mistletoe Lectin I from Viscum album complexed with galactose

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

当前条目没有可用的 UniProt 蛋白身份。

七张关系表仍保留该条目的 assembly 与组成信息,但缺少统一蛋白身份时,不能可靠建立跨 PDB 的同蛋白链接。

当前条目的 assembly 组成

Assembly 物理组成 蛋白状态 蛋白 / DNA / RNA / 其他聚合物 数据核对
1 其他组合 异源复合物 4 / 0 / 0 / 4 与蛋白数一致
2 其他组合 异源复合物 2 / 0 / 0 / 2 与蛋白数一致

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1oql
沉积日期 deposition_date2003-03-10
结构标题 titleMistletoe Lectin I from Viscum album complexed with galactose
关键词 keywordsType-II ribosome-inactivating protein, ricin-like, beta-trefoil, HYDROLASE-SUGAR BINDING PROTEIN COMPLEX; HYDROLASE/SUGAR BINDING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1oql__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1oql__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1oql__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)26.23 Å
Rg(电子密度)25.26 Å
总 Rg25.99 Å
原子数4084
残基数511
排除体积72151 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1oql__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1oql__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd1oqla_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.165 — Ribosome inactivating proteins (RIP)
超家族 Superfamily superfamilyd.165.1 — Ribosome inactivating proteins (RIP)
家族 Family familyd.165.1.1 — Plant cytotoxins
结构域编号 domain_idd1oqlb1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.42 — beta-Trefoil
超家族 Superfamily superfamilyb.42.2 — Ricin B-like lectins
家族 Family familyb.42.2.1 — Ricin B-like
结构域编号 domain_idd1oqlb2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.42 — beta-Trefoil
超家族 Superfamily superfamilyb.42.2 — Ricin B-like lectins
家族 Family familyb.42.2.1 — Ricin B-like

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1oqlA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology420 — Ricin (A subunit); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Ricin (A subunit), domain 1
结构域编号 domain_id1oqlA02
类 Class class4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture10 — Irregular
拓扑 Topology topology470 — Ricin (A Subunit), domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Ricin (A Subunit), domain 2
结构域编号 domain_id1oqlB01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture80 — Trefoil
拓扑 Topology topology10 — Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily50 —
结构域编号 domain_id1oqlB02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture80 — Trefoil
拓扑 Topology topology10 — Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily50 —
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7. 引用文献 (3)