1ovo

CRYSTALLOGRAPHIC REFINEMENT OF JAPANESE QUAIL OVOMUCOID, A KAZAL-TYPE INHIBITOR, AND MODEL BUILDING STUDIES OF COMPLEXES WITH SERINE PROTEASES

Method: X-RAY DIFFRACTION
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

OVOMUCOID THIRD DOMAIN

Coturnix japonica

UniProt P01003

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 4 water × 4 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 4 water × 4 与蛋白数一致
3 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 4 无其他共同聚合物 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 IOVO_COTJA
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–56; UniProt 131–186 作者链 B; PDB构建体 1–56; UniProt 131–186 作者链 C; PDB构建体 1–56; UniProt 131–186 作者链 D; PDB构建体 1–56; UniProt 131–186

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1ovo
沉积日期 deposition_date1982-01-18
结构标题 titleCRYSTALLOGRAPHIC REFINEMENT OF JAPANESE QUAIL OVOMUCOID, A KAZAL-TYPE INHIBITOR, AND MODEL BUILDING STUDIES OF COMPLEXES WITH SERINE PROTEASES
关键词 keywordsPROTEINASE INHIBITOR (KAZAL); PROTEINASE INHIBITOR (KAZAL)
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1ovo__assembly_3__model_1

Assembly 3 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1ovo__assembly_3__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1ovo__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)18.06 Å
Rg(电子密度)17.06 Å
总 Rg17.99 Å
原子数1684
残基数224
排除体积29605 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1ovo__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1ovo__assembly_2__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 1ovo__assembly_3__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd1ovoa_
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.68 — Kazal-type serine protease inhibitors
超家族 Superfamily superfamilyg.68.1 — Kazal-type serine protease inhibitors
家族 Family familyg.68.1.1 — Ovomucoid domain III-like
结构域编号 domain_idd1ovob_
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.68 — Kazal-type serine protease inhibitors
超家族 Superfamily superfamilyg.68.1 — Kazal-type serine protease inhibitors
家族 Family familyg.68.1.1 — Ovomucoid domain III-like
结构域编号 domain_idd1ovoc_
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.68 — Kazal-type serine protease inhibitors
超家族 Superfamily superfamilyg.68.1 — Kazal-type serine protease inhibitors
家族 Family familyg.68.1.1 — Ovomucoid domain III-like
结构域编号 domain_idd1ovod_
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.68 — Kazal-type serine protease inhibitors
超家族 Superfamily superfamilyg.68.1 — Kazal-type serine protease inhibitors
家族 Family familyg.68.1.1 — Ovomucoid domain III-like

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1ovoA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology60 — Wheat Germ Agglutinin (Isolectin 2); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 —
结构域编号 domain_id1ovoB00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology60 — Wheat Germ Agglutinin (Isolectin 2); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 —
结构域编号 domain_id1ovoC00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology60 — Wheat Germ Agglutinin (Isolectin 2); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 —
结构域编号 domain_id1ovoD00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology60 — Wheat Germ Agglutinin (Isolectin 2); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 —
▶

7. 引用文献 (3)