Invasin
Yersinia enterocolitica
当前结构中的状态
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 3 | water × 3 | 与蛋白数一致 |
数据库中的同蛋白其他状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | YADA1_YEREN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 11–226； UniProt 26–241 |
1p9h
CRYSTAL STRUCTURE OF THE COLLAGEN-BINDING DOMAIN OF YERSINIA ADHESIN YadA
1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
2. 结构基本信息 2. Structure Basics
| 条目编号 entry_id | 1p9h |
| 沉积日期 deposition_date | 2003-05-12 |
| 结构标题 title | CRYSTAL STRUCTURE OF THE COLLAGEN-BINDING DOMAIN OF YERSINIA ADHESIN YadA |
| 关键词 keywords | collagen-binding, left-handed beta-roll, CELL ADHESION; CELL ADHESION |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
1p9h__assembly_1__model_1
Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
1p9h__assembly_1__model_1 | I(q)
1p9h__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending
| Rg（Guinier） | 23.60 Å |
| Rg（电子密度） | 23.34 Å |
| 总 Rg | 24.11 Å |
| 原子数 | 3684 |
| 残基数 | 537 |
| 排除体积 | 64472 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment
5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)
6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains
SCOP 2.08 (1 domains)
| 结构域编号 domain_id | d1p9ha_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.81 — Single-stranded left-handed beta-helix |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.81.3 — Adhesin YadA, collagen-binding domain |
| 家族 Family family | b.81.3.1 — Adhesin YadA, collagen-binding domain |
CATH v4.4 (1 domains)
| 结构域编号 domain_id | 1p9hA00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 150 — 2 Solenoid |
| 拓扑 Topology topology | 10 — Alkaline Protease, subunit P, domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Serralysin-like metalloprotease, C-terminal |