1pe3

Solution structure of the disulphide-linked dimer of human intestinal trefoil factor (TFF3)

Method: SOLUTION NMR

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Trefoil factor 3

Homo sapiens

UniProt Q07654

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 无其他共同聚合物 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TFF3_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 1; PDB构建体 1–59; UniProt 22–80 作者链 2; PDB构建体 1–59; UniProt 22–80

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1pe3
沉积日期 deposition_date2003-05-21
结构标题 titleSolution structure of the disulphide-linked dimer of human intestinal trefoil factor (TFF3)
关键词 keywords;intestinal trefoil factor, ITF, trefoil factor family, TFF3, TFF3 dimer, trefoil motif, solution structure, NMR spectroscopy, CELL CYCLE ;; CELL CYCLE
实验方法 methodSOLUTION NMR

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1pe3__assembly_1__model_30

Assembly 1 · Model 30 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1pe3__assembly_1__model_30 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1pe3__assembly_1__model_30 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)14.95 Å
Rg(电子密度)14.48 Å
总 Rg15.36 Å
原子数1756
残基数118
排除体积16026 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1pe3__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 1pe3__assembly_1__model_2 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 1pe3__assembly_1__model_3 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 1pe3__assembly_1__model_4 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 1pe3__assembly_1__model_5 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 1pe3__assembly_1__model_6 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 1pe3__assembly_1__model_7 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 1pe3__assembly_1__model_8 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 1pe3__assembly_1__model_9 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 1pe3__assembly_1__model_10 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 11 1pe3__assembly_1__model_11 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 12 1pe3__assembly_1__model_12 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 13 1pe3__assembly_1__model_13 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 14 1pe3__assembly_1__model_14 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 15 1pe3__assembly_1__model_15 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 16 1pe3__assembly_1__model_16 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 17 1pe3__assembly_1__model_17 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 18 1pe3__assembly_1__model_18 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 19 1pe3__assembly_1__model_19 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 20 1pe3__assembly_1__model_20 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 21 1pe3__assembly_1__model_21 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 22 1pe3__assembly_1__model_22 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 23 1pe3__assembly_1__model_23 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 24 1pe3__assembly_1__model_24 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 25 1pe3__assembly_1__model_25 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 26 1pe3__assembly_1__model_26 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 27 1pe3__assembly_1__model_27 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 28 1pe3__assembly_1__model_28 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 29 1pe3__assembly_1__model_29 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 30 1pe3__assembly_1__model_30 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 31 1pe3__assembly_1__model_31 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 32 1pe3__assembly_1__model_32 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 33 1pe3__assembly_1__model_33 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 34 1pe3__assembly_1__model_34 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 35 1pe3__assembly_1__model_35 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 36 1pe3__assembly_1__model_36 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 37 1pe3__assembly_1__model_37 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 38 1pe3__assembly_1__model_38 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 39 1pe3__assembly_1__model_39 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 40 1pe3__assembly_1__model_40 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 41 1pe3__assembly_1__model_41 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 42 1pe3__assembly_1__model_42 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 43 1pe3__assembly_1__model_43 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 44 1pe3__assembly_1__model_44 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 45 1pe3__assembly_1__model_45 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 46 1pe3__assembly_1__model_46 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 47 1pe3__assembly_1__model_47 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd1pe31_
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.16 — Trefoil/Plexin domain-like
超家族 Superfamily superfamilyg.16.1 — Trefoil
家族 Family familyg.16.1.1 — Trefoil
结构域编号 domain_idd1pe32_
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.16 — Trefoil/Plexin domain-like
超家族 Superfamily superfamilyg.16.1 — Trefoil
家族 Family familyg.16.1.1 — Trefoil

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id1pe3100
类 Class class4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture10 — Irregular
拓扑 Topology topology110 — Spasmolytic Protein; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Spasmolytic Protein, domain 1
结构域编号 domain_id1pe3200
类 Class class4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture10 — Irregular
拓扑 Topology topology110 — Spasmolytic Protein; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Spasmolytic Protein, domain 1

7. 引用文献 (1)