1pfm

PF4-M2 CHIMERIC MUTANT WITH THE FIRST 10 N-TERMINAL RESIDUES OF R-PF4 REPLACED BY THE N-TERMINAL RESIDUES OF THE IL8 SEQUENCE. MODELS 1-15 OF A 27-MODEL SET.

Method: SOLUTION NMR

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PF4-M2 CHIMERA

Homo sapiens

UniProt P02776

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 4 无其他共同聚合物 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PLF4_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 6–68; UniProt 39–101 作者链 B; PDB构建体 6–68; UniProt 39–101 作者链 C; PDB构建体 6–68; UniProt 39–101 作者链 D; PDB构建体 6–68; UniProt 39–101

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1pfm
沉积日期 deposition_date1995-07-18
结构标题 titlePF4-M2 CHIMERIC MUTANT WITH THE FIRST 10 N-TERMINAL RESIDUES OF R-PF4 REPLACED BY THE N-TERMINAL RESIDUES OF THE IL8 SEQUENCE. MODELS 1-15 OF A 27-MODEL SET.
关键词 keywordsCYTOKINE; CYTOKINE
实验方法 methodSOLUTION NMR

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1pfm__assembly_1__model_8

Assembly 1 · Model 8 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1pfm__assembly_1__model_8 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1pfm__assembly_1__model_8 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)19.69 Å
Rg(电子密度)18.48 Å
总 Rg19.74 Å
原子数4460
残基数272
排除体积38894 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1pfm__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 1pfm__assembly_1__model_2 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 1pfm__assembly_1__model_3 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 1pfm__assembly_1__model_4 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 1pfm__assembly_1__model_5 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 1pfm__assembly_1__model_6 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 1pfm__assembly_1__model_7 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 1pfm__assembly_1__model_8 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 1pfm__assembly_1__model_9 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 1pfm__assembly_1__model_10 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 11 1pfm__assembly_1__model_11 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 12 1pfm__assembly_1__model_12 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 13 1pfm__assembly_1__model_13 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 14 1pfm__assembly_1__model_14 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 15 1pfm__assembly_1__model_15 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd1pfma_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.9 — IL8-like
超家族 Superfamily superfamilyd.9.1 — Interleukin 8-like chemokines
家族 Family familyd.9.1.1 — Interleukin 8-like chemokines
结构域编号 domain_idd1pfmb_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.9 — IL8-like
超家族 Superfamily superfamilyd.9.1 — Interleukin 8-like chemokines
家族 Family familyd.9.1.1 — Interleukin 8-like chemokines
结构域编号 domain_idd1pfmc_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.9 — IL8-like
超家族 Superfamily superfamilyd.9.1 — Interleukin 8-like chemokines
家族 Family familyd.9.1.1 — Interleukin 8-like chemokines
结构域编号 domain_idd1pfmd_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.9 — IL8-like
超家族 Superfamily superfamilyd.9.1 — Interleukin 8-like chemokines
家族 Family familyd.9.1.1 — Interleukin 8-like chemokines

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1pfmA00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40
结构域编号 domain_id1pfmB00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40
结构域编号 domain_id1pfmC00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40
结构域编号 domain_id1pfmD00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40

7. 引用文献 (2)