1pg6

X-Ray Crystal Structure of Protein SPYM3_0169 from Streptococcus pyogenes. Northeast Structural Genomics Consortium Target DR2.

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hypothetical protein SpyM3_0169

Streptococcus pyogenes

UniProt Q8P2Q3

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 CALCIUM ION × 2 water × 1 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 3 CALCIUM ION × 6 water × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q8P2Q3_STRP3
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 8–243; UniProt 1–236

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1pg6
沉积日期 deposition_date2003-05-27
结构标题 titleX-Ray Crystal Structure of Protein SPYM3_0169 from Streptococcus pyogenes. Northeast Structural Genomics Consortium Target DR2.
关键词 keywords;STRUCTURAL GENOMICS; Streptococcus pyogenes; SpyM3_0169, PSI, Protein Structure Initiative, Northeast Structural Genomics Consortium, NESG, STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION ;; STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1pg6__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1pg6__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1pg6__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)27.32 Å
Rg(电子密度)25.81 Å
总 Rg26.73 Å
原子数4956
残基数618
排除体积88671 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1pg6__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1pg6__assembly_2__model_1 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1pg6a_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.82 — Double-stranded beta-helix
超家族 Superfamily superfamilyb.82.5 — TRAP-like
家族 Family familyb.82.5.2 — PA3696/SPS0176-like

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id1pg6A00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology160 — Double-stranded beta-helix
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Mitochondrial biogenesis AIM24
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7. 引用文献 (1)