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1piv

BINDING OF THE ANTIVIRAL DRUG WIN51711 TO THE SABIN STRAIN OF TYPE 3 POLIOVIRUS: STRUCTURAL COMPARISON WITH DRUG BINDING IN RHINOVIRUS 14

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

POLIOVIRUS TYPE 3 (SUBUNIT VP1)

Poliovirus type 3 (strains P3/LEON/37 AND P3/LEON 12A[1]B)

UniProt P03302

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 300 POLIOVIRUS TYPE 3 (SUBUNIT VP1) × 60 5-(7-(4-(4,5-DIHYDRO-2-OXAZOLYL)PHENOXY)HEPTYL)-3-METHYL ISOXAZOLE × 60 MYRISTIC ACID × 60 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 5 POLIOVIRUS TYPE 3 (SUBUNIT VP1) × 1 5-(7-(4-(4,5-DIHYDRO-2-OXAZOLYL)PHENOXY)HEPTYL)-3-METHYL ISOXAZOLE × 1 MYRISTIC ACID × 1 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 25 POLIOVIRUS TYPE 3 (SUBUNIT VP1) × 5 5-(7-(4-(4,5-DIHYDRO-2-OXAZOLYL)PHENOXY)HEPTYL)-3-METHYL ISOXAZOLE × 5 MYRISTIC ACID × 5 与蛋白数一致
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 30 POLIOVIRUS TYPE 3 (SUBUNIT VP1) × 6 5-(7-(4-(4,5-DIHYDRO-2-OXAZOLYL)PHENOXY)HEPTYL)-3-METHYL ISOXAZOLE × 6 MYRISTIC ACID × 6 与蛋白数一致
5 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 5 POLIOVIRUS TYPE 3 (SUBUNIT VP1) × 1 5-(7-(4-(4,5-DIHYDRO-2-OXAZOLYL)PHENOXY)HEPTYL)-3-METHYL ISOXAZOLE × 1 MYRISTIC ACID × 1 与蛋白数一致
6 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 75 POLIOVIRUS TYPE 3 (SUBUNIT VP1) × 15 5-(7-(4-(4,5-DIHYDRO-2-OXAZOLYL)PHENOXY)HEPTYL)-3-METHYL ISOXAZOLE × 15 MYRISTIC ACID × 15 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
1piv 1piv 1piv 1piv 1piv 1piv 1pvc 1pvc 1pvc 1pvc 1pvc 1pvc

共 62 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 POLG_POL3L
Isoform —
PDB实体 2, 3, 4, 5
链与序列区间 作者链 1； PDB构建体 1–301； UniProt 577–877 作者链 2； PDB构建体 1–271； UniProt 69–339 作者链 3； PDB构建体 1–238； UniProt 340–577 作者链 4； PDB构建体 1–68； UniProt 1–68

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1piv
沉积日期 deposition_date1995-02-02
结构标题 titleBINDING OF THE ANTIVIRAL DRUG WIN51711 TO THE SABIN STRAIN OF TYPE 3 POLIOVIRUS: STRUCTURAL COMPARISON WITH DRUG BINDING IN RHINOVIRUS 14
关键词 keywordsVIRUS, Icosahedral virus; VIRUS
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1piv__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1piv__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 1011 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1piv__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）0.00 Å
Rg（电子密度）132.80 Å
总 Rg132.90 Å
原子数399360
残基数50760
排除体积7093000 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1piv__assembly_1__model_1 complete icosahedral assembly （300） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1piv__assembly_2__model_1 pentameric （5） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
3 1 1piv__assembly_3__model_1 25-meric （25） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
4 1 1piv__assembly_4__model_1 30-meric （30） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
5 1 1piv__assembly_5__model_1 pentameric （5） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
6 1 1piv__assembly_6__model_1 75-meric （75） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd1piv.1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.121 — Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins)
超家族 Superfamily superfamilyb.121.4 — Positive stranded ssRNA viruses
家族 Family familyb.121.4.1 — Picornaviridae-like VP (VP1, VP2, VP3 and VP4)
结构域编号 domain_idd1piv1_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.121 — Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins)
超家族 Superfamily superfamilyb.121.4 — Positive stranded ssRNA viruses
家族 Family familyb.121.4.1 — Picornaviridae-like VP (VP1, VP2, VP3 and VP4)
结构域编号 domain_idd1piv3_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.121 — Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins)
超家族 Superfamily superfamilyb.121.4 — Positive stranded ssRNA viruses
家族 Family familyb.121.4.1 — Picornaviridae-like VP (VP1, VP2, VP3 and VP4)

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1piv100
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 —
结构域编号 domain_id1piv200
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 —
结构域编号 domain_id1piv300
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 —
结构域编号 domain_id1piv400
类 Class class4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture10 — Irregular
拓扑 Topology topology80 — Rhinovirus 14, subunit 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Picornavirus coat protein VP4
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7. 引用文献 (5)