1pk1

Hetero SAM domain structure of Ph and Scm.

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Polyhomeotic-proximal chromatin protein

Drosophila melanogaster

UniProt P39769

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Sex comb on midleg CG9495-PA × 1 (Q9VHA0) water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Sex comb on midleg CG9495-PA × 1 (Q9VHA0) water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PHP_DROME
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 6–81; UniProt 1502–1577 作者链 C; PDB构建体 6–81; UniProt 1502–1577

Sex comb on midleg CG9495-PA

Drosophila melanogaster

UniProt Q9VHA0

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Polyhomeotic-proximal chromatin protein × 1 (P39769) water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Polyhomeotic-proximal chromatin protein × 1 (P39769) water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SCM_DROME
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 6–82; UniProt 795–871 作者链 D; PDB构建体 6–82; UniProt 795–871

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1pk1
沉积日期 deposition_date2003-06-04
结构标题 titleHetero SAM domain structure of Ph and Scm.
关键词 keywordsHetero SAM domain, polymers, transcriptional repression, transcription repression; transcription repression
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1pk1__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1pk1__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1pk1__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)16.60 Å
Rg(电子密度)15.64 Å
总 Rg16.52 Å
原子数1054
残基数131
排除体积19015 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1pk1__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1pk1__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd1pk1a1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.60 — SAM domain-like
超家族 Superfamily superfamilya.60.1 — SAM/Pointed domain
家族 Family familya.60.1.2 — SAM (sterile alpha motif) domain
结构域编号 domain_idd1pk1b1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.60 — SAM domain-like
超家族 Superfamily superfamilya.60.1 — SAM/Pointed domain
家族 Family familya.60.1.2 — SAM (sterile alpha motif) domain
结构域编号 domain_idd1pk1c_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.60 — SAM domain-like
超家族 Superfamily superfamilya.60.1 — SAM/Pointed domain
家族 Family familya.60.1.2 — SAM (sterile alpha motif) domain
结构域编号 domain_idd1pk1d_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.60 — SAM domain-like
超家族 Superfamily superfamilya.60.1 — SAM/Pointed domain
家族 Family familya.60.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1pk1A00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology150 — DNA polymerase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily50 — Transcription Factor, Ets-1
结构域编号 domain_id1pk1B00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology150 — DNA polymerase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily50 — Transcription Factor, Ets-1
结构域编号 domain_id1pk1C00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology150 — DNA polymerase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily50 — Transcription Factor, Ets-1
结构域编号 domain_id1pk1D00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology150 — DNA polymerase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily50 — Transcription Factor, Ets-1
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7. 引用文献 (1)