1pvm

Crystal Structure of a Conserved CBS Domain Protein TA0289 of Unknown Function from Thermoplasma acidophilum

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

conserved hypothetical protein Ta0289

Thermoplasma acidophilum DSM 1728

UniProt Q9HLD9

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 MERCURY (II) ION × 2 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q9HLD9_THEAC
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 7–184; UniProt 1–178 作者链 B; PDB构建体 7–184; UniProt 1–178

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1pvm
沉积日期 deposition_date2003-06-27
结构标题 titleCrystal Structure of a Conserved CBS Domain Protein TA0289 of Unknown Function from Thermoplasma acidophilum
关键词 keywordsSTRUCTURAL GENOMICS, CBS domain, PSI, Protein Structure Initiative, Midwest Center for Structural Genomics, MCSG, UNKNOWN FUNCTION; STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1pvm__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1pvm__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1pvm__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)22.14 Å
Rg(电子密度)20.79 Å
总 Rg21.93 Å
原子数2889
残基数362
排除体积51738 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1pvm__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (5 domains)

结构域编号 domain_idd1pvma3
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.41 — Rubredoxin-like
超家族 Superfamily superfamilyg.41.13 — Hypothetical protein Ta0289 C-terminal domain
家族 Family familyg.41.13.1 — Hypothetical protein Ta0289 C-terminal domain
结构域编号 domain_idd1pvma4
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.37 — CBS-domain pair
超家族 Superfamily superfamilyd.37.1 — CBS-domain pair
家族 Family familyd.37.1.1 — CBS-domain pair
结构域编号 domain_idd1pvmb3
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.41 — Rubredoxin-like
超家族 Superfamily superfamilyg.41.13 — Hypothetical protein Ta0289 C-terminal domain
家族 Family familyg.41.13.1 — Hypothetical protein Ta0289 C-terminal domain
结构域编号 domain_idd1pvmb4
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.37 — CBS-domain pair
超家族 Superfamily superfamilyd.37.1 — CBS-domain pair
家族 Family familyd.37.1.1 — CBS-domain pair
结构域编号 domain_idd1pvmb5
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id1pvmA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology580 — CBS-domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CBS-domain
结构域编号 domain_id1pvmB00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology580 — CBS-domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CBS-domain
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7. 引用文献 (1)