1py2

Structure of a 60 nM Small Molecule Bound to a Hot Spot on IL-2

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 117.8 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Interleukin-2

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 21–152	未记录	FRH 5-[2,3-DICHLORO-4-(5-{1-[2-(2-GUANIDINO-4-METHYL-PENTANOYLAMINO)-ACETYL]-PIPERIDIN-4-YL}-1-METHYL-1H-PYRAZOL-3-YL)-PHENOXYMETHYL]-FURAN-2-CARBOXYLIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；298 K；0.05 M Zinc Acetate, 0.075 M Magnesium Chloride, 18% (w/v) Polyethylene Glycol 10K, 0.1M Sodium Cacodylate, pH 5.9. , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.80 Å R-free 0.320
2	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 21–152	未记录	FRH 5-[2,3-DICHLORO-4-(5-{1-[2-(2-GUANIDINO-4-METHYL-PENTANOYLAMINO)-ACETYL]-PIPERIDIN-4-YL}-1-METHYL-1H-PYRAZOL-3-YL)-PHENOXYMETHYL]-FURAN-2-CARBOXYLIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；298 K；0.05 M Zinc Acetate, 0.075 M Magnesium Chloride, 18% (w/v) Polyethylene Glycol 10K, 0.1M Sodium Cacodylate, pH 5.9. , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.80 Å R-free 0.320
3	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 21–152	未记录	FRH 5-[2,3-DICHLORO-4-(5-{1-[2-(2-GUANIDINO-4-METHYL-PENTANOYLAMINO)-ACETYL]-PIPERIDIN-4-YL}-1-METHYL-1H-PYRAZOL-3-YL)-PHENOXYMETHYL]-FURAN-2-CARBOXYLIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；298 K；0.05 M Zinc Acetate, 0.075 M Magnesium Chloride, 18% (w/v) Polyethylene Glycol 10K, 0.1M Sodium Cacodylate, pH 5.9. , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.80 Å R-free 0.320
4	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 21–152	未记录	FRH 5-[2,3-DICHLORO-4-(5-{1-[2-(2-GUANIDINO-4-METHYL-PENTANOYLAMINO)-ACETYL]-PIPERIDIN-4-YL}-1-METHYL-1H-PYRAZOL-3-YL)-PHENOXYMETHYL]-FURAN-2-CARBOXYLIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；298 K；0.05 M Zinc Acetate, 0.075 M Magnesium Chloride, 18% (w/v) Polyethylene Glycol 10K, 0.1M Sodium Cacodylate, pH 5.9. , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.80 Å R-free 0.320
5	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 21–152	未记录	FRH 5-[2,3-DICHLORO-4-(5-{1-[2-(2-GUANIDINO-4-METHYL-PENTANOYLAMINO)-ACETYL]-PIPERIDIN-4-YL}-1-METHYL-1H-PYRAZOL-3-YL)-PHENOXYMETHYL]-FURAN-2-CARBOXYLIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；298 K；0.05 M Zinc Acetate, 0.075 M Magnesium Chloride, 18% (w/v) Polyethylene Glycol 10K, 0.1M Sodium Cacodylate, pH 5.9. , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.80 Å R-free 0.320
6	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 21–152	未记录	FRH 5-[2,3-DICHLORO-4-(5-{1-[2-(2-GUANIDINO-4-METHYL-PENTANOYLAMINO)-ACETYL]-PIPERIDIN-4-YL}-1-METHYL-1H-PYRAZOL-3-YL)-PHENOXYMETHYL]-FURAN-2-CARBOXYLIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；298 K；0.05 M Zinc Acetate, 0.075 M Magnesium Chloride, 18% (w/v) Polyethylene Glycol 10K, 0.1M Sodium Cacodylate, pH 5.9. , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.80 Å R-free 0.320

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1PY2	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1IRL THE SOLUTION STRUCTURE OF THE F42A MUTANT OF HUMAN INTERLEUKIN 2 提交 1995-08-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 21–153（133 aa）	突变：F42A	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1M47 Crystal Structure of Human Interleukin-2 提交 2002-07-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 21–153（133 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.99 Å R-free 0.245
1M48 Crystal Structure of Human IL-2 Complexed with (R)-N-[2-[1-(Aminoiminomethyl)-3-piperidinyl]-1-oxoethyl]-4-(phenylethynyl)-L-phenylalanine methyl ester 提交 2002-07-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 21–153（133 aa）	未记录	FRG 2-[3-METHYL-4-(N-METHYL-GUANIDINO)-BUTYRYLAMINO]-3-(4-PHENYLETHYNYL-PHENYL)-PROPIONIC ACID METHYL ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.95 Å R-free 0.269
1M48 Crystal Structure of Human IL-2 Complexed with (R)-N-[2-[1-(Aminoiminomethyl)-3-piperidinyl]-1-oxoethyl]-4-(phenylethynyl)-L-phenylalanine methyl ester 提交 2002-07-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 21–153（133 aa）	未记录	FRG 2-[3-METHYL-4-(N-METHYL-GUANIDINO)-BUTYRYLAMINO]-3-(4-PHENYLETHYNYL-PHENYL)-PROPIONIC ACID METHYL ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.95 Å R-free 0.269
1M49 Crystal Structure of Human Interleukin-2 Complexed with SP-1985 提交 2002-07-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 21–153（133 aa）	未记录	CMM 2-[2-(1-CARBAMIMIDOYL-PIPERIDIN-3-YL)-ACETYLAMINO]-3-{4-[2-(3-OXALYL-1H-INDOL-7-YL)ETHYL]-PHENYL}-PROPIONIC ACID METHYL ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.278
1M49 Crystal Structure of Human Interleukin-2 Complexed with SP-1985 提交 2002-07-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 21–153（133 aa）	未记录	CMM 2-[2-(1-CARBAMIMIDOYL-PIPERIDIN-3-YL)-ACETYLAMINO]-3-{4-[2-(3-OXALYL-1H-INDOL-7-YL)ETHYL]-PHENYL}-PROPIONIC ACID METHYL ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.278
1M4A Crystal Structure of Human Interleukin-2 Y31C Covalently Modified at C31 with (1H-Indol-3-yl)-(2-mercapto-ethoxyimino)-acetic acid 提交 2002-07-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 21–153（133 aa）	突变：Y31C	MPE (1H-INDOL-3-YL)-(2-MERCAPTO-ETHOXYIMINO)-ACETIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.18 Å R-free 0.324
1M4B Crystal Structure of Human Interleukin-2 K43C Covalently Modified at C43 with 2-[2-(2-Cyclohexyl-2-guanidino-acetylamino)-acetylamino]-N-(3-mercapto-propyl)-propionamide 提交 2002-07-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 21–153（133 aa）	突变：K43C	NMP 2-[2-(2-CYCLOHEXYL-2-GUANIDINO-ACETYLAMINO)-ACETYLAMINO]-N-(3-MERCAPTO-PROPYL)-PROPIONAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.15 Å R-free 0.286
1M4C Crystal Structure of Human Interleukin-2 提交 2002-07-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 21–153（133 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.40 Å R-free 0.333
1M4C Crystal Structure of Human Interleukin-2 提交 2002-07-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 21–153（133 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.40 Å R-free 0.333
1NBP Crystal Structure Of Human Interleukin-2 Y31C Covalently Modified At C31 With 3-Mercapto-1-(1,3,4,9-tetrahydro-B-carbolin-2-yl)-propan-1-one 提交 2002-12-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 21–153（133 aa）	突变：Y31C	SO4 SULFATE ION × 1 MHC 3-MERCAPTO-1-(1,3,4,9-TETRAHYDRO-B-CARBOLIN-2-YL)-PROPAN-1-ONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；ammonium sulfate, PEG 8k, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.20 Å R-free 0.277
1PW6 Low Micromolar Small Molecule Inhibitor of IL-2 提交 2003-06-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 21–153（133 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 FRB 2-CYCLOHEXYL-N-(2-{4-[5-(2,3-DICHLORO-PHENYL)-2H-PYRAZOL-3-YL]-PIPERIDIN-1-YL}-2-OXO-ETHYL)-2-GUANIDINO-ACETAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；lithium sulfate, ammonium sulfate, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.60 Å R-free 0.292
1PW6 Low Micromolar Small Molecule Inhibitor of IL-2 提交 2003-06-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 21–153（133 aa）	未记录	FRB 2-CYCLOHEXYL-N-(2-{4-[5-(2,3-DICHLORO-PHENYL)-2H-PYRAZOL-3-YL]-PIPERIDIN-1-YL}-2-OXO-ETHYL)-2-GUANIDINO-ACETAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；lithium sulfate, ammonium sulfate, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.60 Å R-free 0.292
1PW6 Low Micromolar Small Molecule Inhibitor of IL-2 提交 2003-06-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 21–153（133 aa）链 B 21–153（133 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 FRB 2-CYCLOHEXYL-N-(2-{4-[5-(2,3-DICHLORO-PHENYL)-2H-PYRAZOL-3-YL]-PIPERIDIN-1-YL}-2-OXO-ETHYL)-2-GUANIDINO-ACETAMIDE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；lithium sulfate, ammonium sulfate, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.60 Å R-free 0.292
1PW6 Low Micromolar Small Molecule Inhibitor of IL-2 提交 2003-06-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 21–153（133 aa）链 B 21–153（133 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 FRB 2-CYCLOHEXYL-N-(2-{4-[5-(2,3-DICHLORO-PHENYL)-2H-PYRAZOL-3-YL]-PIPERIDIN-1-YL}-2-OXO-ETHYL)-2-GUANIDINO-ACETAMIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；lithium sulfate, ammonium sulfate, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.60 Å R-free 0.292
1QVN Structure of SP4160 Bound to IL-2 V69A 提交 2003-08-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 21–152（132 aa）链 C 21–152（132 aa）	突变：V69A 突变：V69A	ZN ZINC ION × 2 FRI 2-GUANIDINO-4-METHYL-PENTANOIC ACID [2-(4-{5-[4-(4-ACETYLAMINO-BENZYLOXY)-2,3-DICHLORO-PHENYL]-2-METHYL-2H-PYRAZOL-3-YL}-PIPERIDIN-1-YL)-2-OXO-ETHYL]-AMIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；298 K；0.05 M Zinc Acetate, 0.075 M Magnesium Chloride, 18% (w/v) Polyethylene Glycol 10K, 0.1M Sodium Cacodylate, pH 5.9. , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.70 Å R-free 0.308
1QVN Structure of SP4160 Bound to IL-2 V69A 提交 2003-08-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 21–152（132 aa）链 D 21–152（132 aa）	突变：V69A 突变：V69A	ZN ZINC ION × 2 FRI 2-GUANIDINO-4-METHYL-PENTANOIC ACID [2-(4-{5-[4-(4-ACETYLAMINO-BENZYLOXY)-2,3-DICHLORO-PHENYL]-2-METHYL-2H-PYRAZOL-3-YL}-PIPERIDIN-1-YL)-2-OXO-ETHYL]-AMIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；298 K；0.05 M Zinc Acetate, 0.075 M Magnesium Chloride, 18% (w/v) Polyethylene Glycol 10K, 0.1M Sodium Cacodylate, pH 5.9. , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.70 Å R-free 0.308
1QVN Structure of SP4160 Bound to IL-2 V69A 提交 2003-08-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 21–152（132 aa）链 B 21–152（132 aa）链 C 21–152（132 aa）链 D 21–152（132 aa）	突变：V69A 突变：V69A 突变：V69A 突变：V69A	ZN ZINC ION × 4 FRI 2-GUANIDINO-4-METHYL-PENTANOIC ACID [2-(4-{5-[4-(4-ACETYLAMINO-BENZYLOXY)-2,3-DICHLORO-PHENYL]-2-METHYL-2H-PYRAZOL-3-YL}-PIPERIDIN-1-YL)-2-OXO-ETHYL]-AMIDE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；298 K；0.05 M Zinc Acetate, 0.075 M Magnesium Chloride, 18% (w/v) Polyethylene Glycol 10K, 0.1M Sodium Cacodylate, pH 5.9. , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.70 Å R-free 0.308
1QVN Structure of SP4160 Bound to IL-2 V69A 提交 2003-08-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 21–152（132 aa）链 C 21–152（132 aa）	突变：V69A 突变：V69A	ZN ZINC ION × 2 FRI 2-GUANIDINO-4-METHYL-PENTANOIC ACID [2-(4-{5-[4-(4-ACETYLAMINO-BENZYLOXY)-2,3-DICHLORO-PHENYL]-2-METHYL-2H-PYRAZOL-3-YL}-PIPERIDIN-1-YL)-2-OXO-ETHYL]-AMIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；298 K；0.05 M Zinc Acetate, 0.075 M Magnesium Chloride, 18% (w/v) Polyethylene Glycol 10K, 0.1M Sodium Cacodylate, pH 5.9. , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.70 Å R-free 0.308
1Z92 structure of interleukin-2 with its alpha receptor 提交 2005-03-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 21–153（133 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；Na-malonic acid, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.280
2B5I cytokine receptor complex 提交 2005-09-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 21–153（133 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.1；293 K；29% Pentaerythritol Ethoxylate 15/4; 50 mM Ammonium Sulfate; 50 mM Bis Tris, pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.30 Å R-free 0.269
2ERJ Crystal structure of the heterotrimeric interleukin-2 receptor in complex with interleukin-2 提交 2005-10-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 21–153（133 aa）	突变：C125A	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.1；295.5 K；MPEG 550, sodium acetate, sodium citrate, phenol, pH 5.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.5K	分辨率 3.00 Å R-free 0.263
2ERJ Crystal structure of the heterotrimeric interleukin-2 receptor in complex with interleukin-2 提交 2005-10-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 H 21–153（133 aa）	突变：C125A	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.1；295.5 K；MPEG 550, sodium acetate, sodium citrate, phenol, pH 5.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.5K	分辨率 3.00 Å R-free 0.263
3INK UNRAVELING THE STRUCTURE OF INTERLEUKIN-2: REPLY 提交 1992-12-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 21–153（133 aa）链 D 21–153（133 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 21–153（133 aa）片段：unp residues 21-153	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 10 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 b 21–153（133 aa）片段：unp residues 21-153	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 11 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 e 21–153（133 aa）片段：unp residues 21-153	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 12 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 h 21–153（133 aa）片段：unp residues 21-153	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 21–153（133 aa）片段：unp residues 21-153	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 21–153（133 aa）片段：unp residues 21-153	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 21–153（133 aa）片段：unp residues 21-153	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 M 21–153（133 aa）片段：unp residues 21-153	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 P 21–153（133 aa）片段：unp residues 21-153	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 S 21–153（133 aa）片段：unp residues 21-153	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 V 21–153（133 aa）片段：unp residues 21-153	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 9 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 Y 21–153（133 aa）片段：unp residues 21-153	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QB1 Interleukin-2 mutant D10 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 21–153（133 aa）	突变：Q74H, L80F, R81D, L85V, I86V, I92F	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；298 K；50 mM HEPES, 200 mM NaCl, 30% PEG-4000, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.10 Å R-free 0.263
3QB1 Interleukin-2 mutant D10 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 21–153（133 aa）	突变：Q74H, L80F, R81D, L85V, I86V, I92F	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；298 K；50 mM HEPES, 200 mM NaCl, 30% PEG-4000, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.10 Å R-free 0.263
3QB1 Interleukin-2 mutant D10 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 21–153（133 aa）	突变：Q74H, L80F, R81D, L85V, I86V, I92F	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；298 K；50 mM HEPES, 200 mM NaCl, 30% PEG-4000, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.10 Å R-free 0.263
3QB1 Interleukin-2 mutant D10 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 21–153（133 aa）	突变：Q74H, L80F, R81D, L85V, I86V, I92F	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；298 K；50 mM HEPES, 200 mM NaCl, 30% PEG-4000, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.10 Å R-free 0.263
3QB1 Interleukin-2 mutant D10 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 21–153（133 aa）	突变：Q74H, L80F, R81D, L85V, I86V, I92F	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；298 K；50 mM HEPES, 200 mM NaCl, 30% PEG-4000, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.10 Å R-free 0.263
3QB1 Interleukin-2 mutant D10 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 F 21–153（133 aa）	突变：Q74H, L80F, R81D, L85V, I86V, I92F	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；298 K；50 mM HEPES, 200 mM NaCl, 30% PEG-4000, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.10 Å R-free 0.263
3QB1 Interleukin-2 mutant D10 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 G 21–153（133 aa）	突变：Q74H, L80F, R81D, L85V, I86V, I92F	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；298 K；50 mM HEPES, 200 mM NaCl, 30% PEG-4000, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.10 Å R-free 0.263
3QB1 Interleukin-2 mutant D10 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 H 21–153（133 aa）	突变：Q74H, L80F, R81D, L85V, I86V, I92F	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；298 K；50 mM HEPES, 200 mM NaCl, 30% PEG-4000, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.10 Å R-free 0.263
5LQB Complex structure of human IL2 mutant, Proleukin, with Fab fragment of NARA1 antibody 提交 2016-08-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 22–153（132 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG3350 0.2M Sodium Nitrate	分辨率 1.95 Å R-free 0.291
5UTZ Human IL-2/Fab complex 提交 2017-02-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 21–153（133 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；100 mM sodium citrate, pH 5.0, 20% PEG6000	分辨率 2.75 Å R-free 0.247
5UTZ Human IL-2/Fab complex 提交 2017-02-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 21–153（133 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；100 mM sodium citrate, pH 5.0, 20% PEG6000	分辨率 2.75 Å R-free 0.247
5UTZ Human IL-2/Fab complex 提交 2017-02-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 21–153（133 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；100 mM sodium citrate, pH 5.0, 20% PEG6000	分辨率 2.75 Å R-free 0.247
5UTZ Human IL-2/Fab complex 提交 2017-02-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 21–153（133 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；100 mM sodium citrate, pH 5.0, 20% PEG6000	分辨率 2.75 Å R-free 0.247
6LX3 Cryo-EM structure of human secretory immunoglobulin A 提交 2020-02-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–21（21 aa）链 B 1–21（21 aa）链 C 1–21（21 aa）链 D 1–21（21 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.15 Å
6LXW Cryo-EM structure of human secretory immunoglobulin A in complex with the N-terminal domain of SpsA 提交 2020-02-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–21（21 aa）链 B 1–21（21 aa）链 C 1–21（21 aa）链 D 1–21（21 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.27 Å
6VWU X-ray structure of ALKS 4230, a fusion of circularly permuted human Interleukin-2 and Interleukin-2 Receptor alpha 提交 2020-02-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 24–94（71 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；An equal volume of protein was mixed with crystallization buffer, 25 % (w/v) PEG 3350, 0.2 M MgCl2, 0.1 M Hepes 7.5. Large crystals appeared within 48-72 hours, and were frozen in a cryoprotectant consisting of mother liquor with 10 % glycerol	分辨率 3.40 Å R-free 0.297
6YE3 IL-2 in complex with a Fab fragment from UFKA-20 提交 2020-03-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 21–153（133 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10.86% (v/v) PEG 8000, 5.76% (v/v) ethylene glycol, 100 mM HEPES, pH 7.48	分辨率 2.89 Å R-free 0.283
6YE3 IL-2 in complex with a Fab fragment from UFKA-20 提交 2020-03-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 21–153（133 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10.86% (v/v) PEG 8000, 5.76% (v/v) ethylene glycol, 100 mM HEPES, pH 7.48	分辨率 2.89 Å R-free 0.283
6YE3 IL-2 in complex with a Fab fragment from UFKA-20 提交 2020-03-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 21–153（133 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10.86% (v/v) PEG 8000, 5.76% (v/v) ethylene glycol, 100 mM HEPES, pH 7.48	分辨率 2.89 Å R-free 0.283
7DR4 Complex of anti-human IL-2 antibody and human IL-2 提交 2020-12-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 K 21–153（133 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2M NH4NO3, pH4.8, 25% PEG3350	分辨率 2.49 Å R-free 0.258
7DR4 Complex of anti-human IL-2 antibody and human IL-2 提交 2020-12-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 21–153（133 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2M NH4NO3, pH4.8, 25% PEG3350	分辨率 2.49 Å R-free 0.258
7DR4 Complex of anti-human IL-2 antibody and human IL-2 提交 2020-12-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 21–153（133 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2M NH4NO3, pH4.8, 25% PEG3350	分辨率 2.49 Å R-free 0.258
7DR4 Complex of anti-human IL-2 antibody and human IL-2 提交 2020-12-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 21–153（133 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2M NH4NO3, pH4.8, 25% PEG3350	分辨率 2.49 Å R-free 0.258
7M2G INTERLEUKIN-2 (human) mutant P65K, C125S 提交 2021-03-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 21–153（133 aa）片段：IL2	突变：P65K, C125S	SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.75；293 K；1.75M (NH4)2SO4, 0.10 M HEPES/NaOH pH=7.75 at a protein concentration of 37 mg/ml.	分辨率 1.79 Å R-free 0.228
7RA9 Designed StabIL-2 seq1 提交 2021-06-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 21–153（133 aa）	突变：G27M, I28L, K32D, M39L, E52S, V69A, L72A, Q74G, S75D, K76D, N77P, F78K, H79T, L80I, delta81-82, L85V, I86V, I92F, V115I	PO4 PHOSPHATE ION × 3 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10.5；295 K；0.2 M Li2SO4, 0.1 M CAPS pH 10.5, 1.2 M NaH2PO4, and 0.8 M K2HPO4	分辨率 2.20 Å R-free 0.293
7RAA Designed StabIL-2 seq15 提交 2021-06-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 21–153（133 aa）	突变：G27M, I28L, K32D, V69A, L72Q, R81D, V115I	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；295 K；0.2 M MgCl2, 0.1 M Tris pH 8.3, 24% PEG 3350 with microseeding	分辨率 2.69 Å R-free 0.294
7RAA Designed StabIL-2 seq15 提交 2021-06-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 21–153（133 aa）	突变：G27M, I28L, K32D, V69A, L72Q, R81D, V115I	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；295 K；0.2 M MgCl2, 0.1 M Tris pH 8.3, 24% PEG 3350 with microseeding	分辨率 2.69 Å R-free 0.294
7RAA Designed StabIL-2 seq15 提交 2021-06-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 21–153（133 aa）	突变：G27M, I28L, K32D, V69A, L72Q, R81D, V115I	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；295 K；0.2 M MgCl2, 0.1 M Tris pH 8.3, 24% PEG 3350 with microseeding	分辨率 2.69 Å R-free 0.294
7RAA Designed StabIL-2 seq15 提交 2021-06-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 21–153（133 aa）	突变：G27M, I28L, K32D, V69A, L72Q, R81D, V115I	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；295 K；0.2 M MgCl2, 0.1 M Tris pH 8.3, 24% PEG 3350 with microseeding	分辨率 2.69 Å R-free 0.294
7ZMZ Engineered Interleukin 2 bound to CD25 receptor 提交 2022-04-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 20–153（134 aa）	突变：T37H, R38L, T41S, F42Y, K43G	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；19% PEG 3350, 0.2 M Sodium tartrate dibasic dihydrate, 10% glycerol	分辨率 3.20 Å R-free 0.258
8SOW Structure of the complex formed by human interleukin-2 and scFv F10 提交 2023-04-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 20–153（134 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；15-30% PEG 3350, 0.1-0.35 M ammonium fluoride	分辨率 1.71 Å R-free 0.235
8SOZ Structure of the complex formed by human interleukin-2 and scFv 602 提交 2023-04-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 20–153（134 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；15-30% PEG 3350, 0.1-0.35 ammonium fluoride	分辨率 1.64 Å R-free 0.250
8WYR Cryo-EM structure of human CD5L bound to IgM-Fc/J 提交 2023-10-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–21（21 aa）链 B 1–21（21 aa）链 C 1–21（21 aa）链 D 1–21（21 aa）链 E 1–21（21 aa）链 F 1–21（21 aa）链 G 1–21（21 aa）链 H 1–21（21 aa）链 K 1–21（21 aa）链 L 1–21（21 aa）链 M 1–21（21 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.39 Å
8WYS Local map of human CD5L bound to IgM-Fc/J 提交 2023-10-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–21（21 aa）链 L 1–21（21 aa）链 M 1–21（21 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.41 Å
9KMC Cryo-EM structure of the heterotrimeric interleukin-2 receptor in complex with interleukin-2 and anti-CD25 Fab S417 提交 2024-11-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 D 21–153（133 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.97 Å
9MBZ Cryo-EM structure of human FcRL4 bound to IgA-Fc/J 提交 2025-03-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–21（21 aa）链 B 1–21（21 aa）链 C 1–21（21 aa）链 D 1–21（21 aa）链 F 1–21（21 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.30 Å

共 33 个其他 PDB 条目、72 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	IL2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–132； UniProt 21–152 作者链 B； PDB构建体 1–132； UniProt 21–152 作者链 C； PDB构建体 1–132； UniProt 21–152 作者链 D； PDB构建体 1–132； UniProt 21–152

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1py2
沉积日期 deposition_date	2003-07-07
结构标题 title	Structure of a 60 nM Small Molecule Bound to a Hot Spot on IL-2
关键词 keywords	IL-2, interleukin 2, small molecule, hot spot, molecular recognition, IMMUNE SYSTEM; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	39.90 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	39.57 Å
零角强度 I(0) i0	46555600.00
分子量 molecular_weight	57514.0 kDa
排除体积 excluded_volume	73259 Å³
包络体积 envelope_volume	116760 Å³
水化壳体积 shell_volume	26512 Å³
包络直径 envelope_diameter	116.9 Å
壳层 Rg shell_rg	42.03 Å
包络 Rg envelope_rg	37.63 Å
形状 Rg shape_rg	39.59 Å
总 Rg total_rg	39.72 Å
总原子数 total_atoms	4015
残基数 n_residues	468
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	117.8 Å
Rg (实空间) rg_real	39.79 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.14 Å
I(0) (实空间) i0_real	4.6560e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	8.0620e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	39.87 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	46560000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8073
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	64.8 Å
偏度 Skewness skewness	-0.098
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.995
角度范围 angular_range	— – 0.2000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	1835000.0000
实空间数据点数 n_real_points	41
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.640; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.839; Smooth: 0.732

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Interleukin-2
分子量 formula_weight	15334.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	4015

APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTFKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTL

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	;5-[2,3-DICHLORO-4-(5-{1-[2-(2-GUANIDINO-4-METHYL-PENTANOYLAMINO)-ACETYL]-PIPERIDIN-4-YL}-1-METHYL-1H-PYRAZOL-3-YL)-PHENOXYMETHYL]-FURAN-2-CARBOXYLIC ACID ;
分子量 formula_weight	662.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d1py2a_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.26 — 4-helical cytokines
超家族 Superfamily superfamily	a.26.1 — 4-helical cytokines
家族 Family family	a.26.1.2 — Short-chain cytokines

结构域编号 domain_id	d1py2b_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.26 — 4-helical cytokines
超家族 Superfamily superfamily	a.26.1 — 4-helical cytokines
家族 Family family	a.26.1.2 — Short-chain cytokines

结构域编号 domain_id	d1py2c_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.26 — 4-helical cytokines
超家族 Superfamily superfamily	a.26.1 — 4-helical cytokines
家族 Family family	a.26.1.2 — Short-chain cytokines

结构域编号 domain_id	d1py2d_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.26 — 4-helical cytokines
超家族 Superfamily superfamily	a.26.1 — 4-helical cytokines
家族 Family family	a.26.1.2 — Short-chain cytokines

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	1py2A00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	1py2B00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	1py2C00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	1py2D00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	59.982 Å
晶胞边长 b length_b	52.448 Å
晶胞边长 c length_c	89.469 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	106.34 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.800 Å
最低分辨率 resolution_low	15.000 Å
R 因子 r_factor	0.2734
R_work r_work	0.2711
R_free r_free	0.3196

fit	/app/data/saxs_computation/py/1py2/1py2.fit
pddf	/app/data/pr_computation/py/1py2/1py2.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/py/1py2/1py2.dat