1q55

W-shaped trans interactions of cadherins model based on fitting C-cadherin (1L3W) to 3D map of desmosomes obtained by electron tomography

Method: ELECTRON MICROSCOPY
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

当前条目没有可用的 UniProt 蛋白身份。

七张关系表仍保留该条目的 assembly 与组成信息,但缺少统一蛋白身份时,不能可靠建立跨 PDB 的同蛋白链接。

当前条目的 assembly 组成

Assembly 物理组成 蛋白状态 蛋白 / DNA / RNA / 其他聚合物 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 4 / 0 / 0 / 0 与蛋白数一致

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1q55
沉积日期 deposition_date2003-08-06
结构标题 titleW-shaped trans interactions of cadherins model based on fitting C-cadherin (1L3W) to 3D map of desmosomes obtained by electron tomography
关键词 keywordsCADHERIN; TRANS INTERACTION; DESMOSOME; JUNCTION; ADHESION, STRUCTURAL PROTEIN; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1q55__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1q55__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1q55__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)0.00 Å
Rg(电子密度)140.80 Å
总 Rg141.00 Å
原子数17652
残基数2160
排除体积314660 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1q55__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd1q55a_
类 Class classi — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold foldi.20 — Ep-cadherin
超家族 Superfamily superfamilyi.20.1 — Ep-cadherin
家族 Family familyi.20.1.1 — Ep-cadherin
结构域编号 domain_idd1q55b_
类 Class classi — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold foldi.20 — Ep-cadherin
超家族 Superfamily superfamilyi.20.1 — Ep-cadherin
家族 Family familyi.20.1.1 — Ep-cadherin
结构域编号 domain_idd1q55c_
类 Class classi — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold foldi.20 — Ep-cadherin
超家族 Superfamily superfamilyi.20.1 — Ep-cadherin
家族 Family familyi.20.1.1 — Ep-cadherin
结构域编号 domain_idd1q55d_
类 Class classi — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold foldi.20 — Ep-cadherin
超家族 Superfamily superfamilyi.20.1 — Ep-cadherin
家族 Family familyi.20.1.1 — Ep-cadherin
▶

7. 引用文献 (1)