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1qho

FIVE-DOMAIN ALPHA-AMYLASE FROM BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS, MALTOSE/ACARBOSE COMPLEX

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ALPHA-AMYLASE

Geobacillus stearothermophilus

UniProt P19531

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 其他组合 单体 蛋白 1 其他聚合物 3 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 2 ;alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-4-amino-4,6-dideoxy-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose ; × 1 CALCIUM ION × 3 SULFATE ION × 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
1qho 1qhp

共 2 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 AMYM_BACST
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–686； UniProt 34–717

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1qho
沉积日期 deposition_date1999-05-25
结构标题 titleFIVE-DOMAIN ALPHA-AMYLASE FROM BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS, MALTOSE/ACARBOSE COMPLEX
关键词 keywordsAMYLASE, GLYCOSIDE HYDROLASE, STARCH DEGRADATION, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1qho__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1qho__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1qho__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）26.35 Å
Rg（电子密度）25.21 Å
总 Rg26.05 Å
原子数5439
残基数686
排除体积95775 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1qho__assembly_1__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd1qhoa1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.18 — E set domains
家族 Family familyb.1.18.2 — E-set domains of sugar-utilizing enzymes
结构域编号 domain_idd1qhoa2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.3 — Prealbumin-like
超家族 Superfamily superfamilyb.3.1 — Starch-binding domain-like
家族 Family familyb.3.1.1 — Starch-binding domain
结构域编号 domain_idd1qhoa3
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.71 — Glycosyl hydrolase domain
超家族 Superfamily superfamilyb.71.1 — Glycosyl hydrolase domain
家族 Family familyb.71.1.1 — alpha-Amylases, C-terminal beta-sheet domain
结构域编号 domain_idd1qhoa4
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamilyc.1.8 — (Trans)glycosidases
家族 Family familyc.1.8.1 — Amylase, catalytic domain

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1qhoA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily80 — Glycosidases
结构域编号 domain_id1qhoA02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1180 — Golgi alpha-mannosidase II
结构域编号 domain_id1qhoA03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id1qhoA04
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
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7. 引用文献 (1)