1qpr

QUINOLINATE PHOSPHORIBOSYLTRANSFERASE (QAPRTASE) FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS IN COMPLEX WITH PHTHALATE AND PRPCP

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

QUINOLINIC ACID PHOSPHORIBOSYLTRANSFERASE

Mycobacterium tuberculosis H37Rv

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	MANGANESE (II) ION × 4 PHTHALIC ACID × 2 1-O-[(R)-hydroxy(phosphonomethyl)phosphoryl]-5-O-phosphono-alpha-D-ribofuranose × 2 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	MANGANESE (II) ION × 4 PHTHALIC ACID × 2 1-O-[(R)-hydroxy(phosphonomethyl)phosphoryl]-5-O-phosphono-alpha-D-ribofuranose × 2 water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	MANGANESE (II) ION × 4 PHTHALIC ACID × 2 1-O-[(R)-hydroxy(phosphonomethyl)phosphoryl]-5-O-phosphono-alpha-D-ribofuranose × 2 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NADC_MYCTU
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–284； UniProt 2–285 作者链 B； PDB构建体 1–284； UniProt 2–285 作者链 C； PDB构建体 1–284； UniProt 2–285 作者链 D； PDB构建体 1–284； UniProt 2–285 作者链 E； PDB构建体 1–284； UniProt 2–285 作者链 F； PDB构建体 1–284； UniProt 2–285

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1qpr
沉积日期 deposition_date	1998-10-17
结构标题 title	QUINOLINATE PHOSPHORIBOSYLTRANSFERASE (QAPRTASE) FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS IN COMPLEX WITH PHTHALATE AND PRPCP
关键词 keywords	;PRTASE, DE NOVO NAD BIOSYNTHESIS, PRPP, TRANSFERASE, PHOSPHORIBOSYLTRANSFERASE, QUINOLINIC ACID, Structural Genomics, PSI, Protein Structure Initiative, TB Structural Genomics Consortium, TBSGC ;; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1qpr__assembly_3__model_1

Assembly 3 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1qpr__assembly_3__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1qpr__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	25.89 Å
Rg（电子密度）	25.21 Å
总 Rg	25.90 Å
原子数	4262
残基数	568
排除体积	75641 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1qpr__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`1qpr__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`1qpr__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	QUINOLINIC ACID PHOSPHORIBOSYLTRANSFERASE
分子量 formula_weight	29850.9 kDa
EC 编号 ec_number	2.4.2.19
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F
原子数 atom_count	13125

GLSDWELAAARAAIARGLDEDLRYGPDVTTLATVPASATTTASLVTREAGVVAGLDVALLTLNEVLGTNGYRVLDRVEDGARVPPGEALMTLEAQTRGLLTAERTMLNLVGHLSGIATATAAWVDAVRGTKAKIRDTRKTLPGLRALQKYAVRTGGGVNHRLGLGDAALIKDNHVAAAGSVVDALRAVRNAAPDLPCEVEVDSLEQLDAVLPEKPELILLDNFAVWQTQTAVQRRDSRAPTVMLESSGGLSLQTAATYAETGVDYLAVGALTHSVRVLDIGLDM

来源 Source

来源生物 organism	Mycobacterium tuberculosis H37Rv
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83332
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	MANGANESE (II) ION
分子量 formula_weight	54.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	12

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	PHTHALIC ACID
分子量 formula_weight	166.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	1-O-[(R)-hydroxy(phosphonomethyl)phosphoryl]-5-O-phosphono-alpha-D-ribofuranose
分子量 formula_weight	388.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	339

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

SCOP 2.08 (12 domains)

结构域编号 domain_id	d1qpra1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.17 — Nicotinate/Quinolinate PRTase C-terminal domain-like
家族 Family family	c.1.17.1 — NadC C-terminal domain-like

结构域编号 domain_id	d1qpra2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.41 — alpha/beta-Hammerhead
超家族 Superfamily superfamily	d.41.2 — Nicotinate/Quinolinate PRTase N-terminal domain-like
家族 Family family	d.41.2.1 — NadC N-terminal domain-like

结构域编号 domain_id	d1qprb1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.17 — Nicotinate/Quinolinate PRTase C-terminal domain-like
家族 Family family	c.1.17.1 — NadC C-terminal domain-like

结构域编号 domain_id	d1qprb2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.41 — alpha/beta-Hammerhead
超家族 Superfamily superfamily	d.41.2 — Nicotinate/Quinolinate PRTase N-terminal domain-like
家族 Family family	d.41.2.1 — NadC N-terminal domain-like

结构域编号 domain_id	d1qprc1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.17 — Nicotinate/Quinolinate PRTase C-terminal domain-like
家族 Family family	c.1.17.1 — NadC C-terminal domain-like

结构域编号 domain_id	d1qprc2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.41 — alpha/beta-Hammerhead
超家族 Superfamily superfamily	d.41.2 — Nicotinate/Quinolinate PRTase N-terminal domain-like
家族 Family family	d.41.2.1 — NadC N-terminal domain-like

结构域编号 domain_id	d1qprd1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.17 — Nicotinate/Quinolinate PRTase C-terminal domain-like
家族 Family family	c.1.17.1 — NadC C-terminal domain-like

结构域编号 domain_id	d1qprd2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.41 — alpha/beta-Hammerhead
超家族 Superfamily superfamily	d.41.2 — Nicotinate/Quinolinate PRTase N-terminal domain-like
家族 Family family	d.41.2.1 — NadC N-terminal domain-like

结构域编号 domain_id	d1qpre1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.17 — Nicotinate/Quinolinate PRTase C-terminal domain-like
家族 Family family	c.1.17.1 — NadC C-terminal domain-like

结构域编号 domain_id	d1qpre2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.41 — alpha/beta-Hammerhead
超家族 Superfamily superfamily	d.41.2 — Nicotinate/Quinolinate PRTase N-terminal domain-like
家族 Family family	d.41.2.1 — NadC N-terminal domain-like

结构域编号 domain_id	d1qprf1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.17 — Nicotinate/Quinolinate PRTase C-terminal domain-like
家族 Family family	c.1.17.1 — NadC C-terminal domain-like

结构域编号 domain_id	d1qprf2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.41 — alpha/beta-Hammerhead
超家族 Superfamily superfamily	d.41.2 — Nicotinate/Quinolinate PRTase N-terminal domain-like
家族 Family family	d.41.2.1 — NadC N-terminal domain-like

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id	1qprA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1170 — Aldehyde Oxidoreductase; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	1qprA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Aldolase class I

结构域编号 domain_id	1qprB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1170 — Aldehyde Oxidoreductase; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	1qprB02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Aldolase class I

结构域编号 domain_id	1qprC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1170 — Aldehyde Oxidoreductase; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	1qprC02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Aldolase class I

结构域编号 domain_id	1qprD01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1170 — Aldehyde Oxidoreductase; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	1qprD02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Aldolase class I

结构域编号 domain_id	1qprE01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1170 — Aldehyde Oxidoreductase; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	1qprE02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Aldolase class I

结构域编号 domain_id	1qprF01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1170 — Aldehyde Oxidoreductase; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	1qprF02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Aldolase class I

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晶胞边长 a length_a	100.448 Å
晶胞边长 b length_b	100.448 Å
晶胞边长 c length_c	145.792 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	18

空间群 space_group	P 31
空间群编号 int_tables_number	144
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.450 Å
最低分辨率 resolution_low	8.000 Å
R 因子 r_factor	0.1860
R_work r_work	0.1860
R_free r_free	0.2510

QUINOLINATE PHOSPHORIBOSYLTRANSFERASE (QAPRTASE) FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS IN COMPLEX WITH PHTHALATE AND PRPCP

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

QUINOLINIC ACID PHOSPHORIBOSYLTRANSFERASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1qpr__assembly_3__model_1

1qpr__assembly_3__model_1 | I(q)

1qpr__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

SCOP 2.08 (12 domains)

CATH v4.4 (12 domains)

7. 引用文献 (1)

QUINOLINATE PHOSPHORIBOSYLTRANSFERASE (QAPRTASE) FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS IN COMPLEX WITH PHTHALATE AND PRPCP

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

QUINOLINIC ACID PHOSPHORIBOSYLTRANSFERASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1qpr__assembly_3__model_1

1qpr__assembly_3__model_1 | I(q)

1qpr__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

SCOP 2.08 (12 domains)

CATH v4.4 (12 domains)

7. 引用文献 (1)