Drosophila melanogaster
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 同源多聚体 | 蛋白 2 DNA 2 | ;DNA (5'-D(*GP*CP*GP*AP*TP*AP*TP*CP*GP*C)-3') ; × 2 SODIUM ION × 1 water × 4 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | HMGD_DROME |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–73； UniProt 2–74 作者链 B； PDB构建体 1–73； UniProt 2–74 |
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| 条目编号 entry_id | 1qrv |
| 沉积日期 deposition_date | 1999-06-15 |
| 结构标题 title | CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLEX OF HMG-D AND DNA |
| 关键词 keywords | PROTEIN-DNA COMPLEX, HMG DOMAIN, NON-SEQUENCE SPECIFIC CHROMOSOMAL PROTEIN HMG-D, GENE REGULATION-DNA COMPLEX; GENE REGULATION/DNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 19.61 Å |
| Rg（电子密度） | 19.54 Å |
| 总 Rg | 20.22 Å |
| 原子数 | 1565 |
| 残基数 | 164 |
| 排除体积 | 26470 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d1qrva_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.21 — HMG-box |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.21.1 — HMG-box |
| 家族 Family family | a.21.1.1 — HMG-box |
| 结构域编号 domain_id | d1qrvb_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.21 — HMG-box |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.21.1 — HMG-box |
| 家族 Family family | a.21.1.1 — HMG-box |
| 结构域编号 domain_id | 1qrvA00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 30 — DNA Binding (I), subunit A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — High mobility group box domain |
| 结构域编号 domain_id | 1qrvB00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 30 — DNA Binding (I), subunit A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — High mobility group box domain |