1qxp

Crystal Structure of a mu-like calpain

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

mu-like calpain

Bos taurus

UniProt P97571

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 单体 蛋白 1 water × 1 与蛋白数一致
2 信息不足 单体 蛋白 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CAN1_RAT
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 50–637; UniProt 60–647 作者链 B; PDB构建体 50–637; UniProt 60–647

mu-like calpain

Bos taurus

UniProt Q07009

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 单体 蛋白 1 water × 1 与蛋白数一致
2 信息不足 单体 蛋白 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CAN2_RAT
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–49; UniProt 1–49 作者链 A; PDB构建体 638–702; UniProt 636–700 作者链 B; PDB构建体 1–49; UniProt 1–49 作者链 B; PDB构建体 638–702; UniProt 636–700

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1qxp
沉积日期 deposition_date2003-09-08
结构标题 titleCrystal Structure of a mu-like calpain
关键词 keywordsm-calpain, mu-calpain, catalytic triad, Ca(2+) requirement, HYDROLASE CHIMERA; HYDROLASE CHIMERA
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1qxp__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1qxp__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1qxp__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)31.49 Å
Rg(电子密度)30.88 Å
总 Rg31.44 Å
原子数6003
残基数788
排除体积105700 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1qxp__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1qxp__assembly_2__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

结构域编号 domain_idd1qxpa1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.39 — EF Hand-like
超家族 Superfamily superfamilya.39.1 — EF-hand
家族 Family familya.39.1.8 — Penta-EF-hand proteins
结构域编号 domain_idd1qxpa2
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.39 — EF Hand-like
超家族 Superfamily superfamilya.39.1 — EF-hand
家族 Family familya.39.1.8 — Penta-EF-hand proteins
结构域编号 domain_idd1qxpa3
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.14 — Calpain large subunit, middle domain (domain III)
超家族 Superfamily superfamilyb.14.1 — Calpain large subunit, middle domain (domain III)
家族 Family familyb.14.1.1 — Calpain large subunit, middle domain (domain III)
结构域编号 domain_idd1qxpa4
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.3 — Cysteine proteinases
超家族 Superfamily superfamilyd.3.1 — Cysteine proteinases
家族 Family familyd.3.1.3 — Calpain large subunit, catalytic domain (domain II)
结构域编号 domain_idd1qxpb1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.39 — EF Hand-like
超家族 Superfamily superfamilya.39.1 — EF-hand
家族 Family familya.39.1.8 — Penta-EF-hand proteins
结构域编号 domain_idd1qxpb2
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.39 — EF Hand-like
超家族 Superfamily superfamilya.39.1 — EF-hand
家族 Family familya.39.1.8 — Penta-EF-hand proteins
结构域编号 domain_idd1qxpb3
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.14 — Calpain large subunit, middle domain (domain III)
超家族 Superfamily superfamilyb.14.1 — Calpain large subunit, middle domain (domain III)
家族 Family familyb.14.1.1 — Calpain large subunit, middle domain (domain III)
结构域编号 domain_idd1qxpb4
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.3 — Cysteine proteinases
超家族 Superfamily superfamilyd.3.1 — Cysteine proteinases
家族 Family familyd.3.1.3 — Calpain large subunit, catalytic domain (domain II)

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id1qxpA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology70 — Cathepsin B; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cysteine proteinases
结构域编号 domain_id1qxpA03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily380 —
结构域编号 domain_id1qxpA04
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — EF-hand
结构域编号 domain_id1qxpA05
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — EF-hand
结构域编号 domain_id1qxpB02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology70 — Cathepsin B; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cysteine proteinases
结构域编号 domain_id1qxpB03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily380 —
结构域编号 domain_id1qxpB04
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — EF-hand
结构域编号 domain_id1qxpB05
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — EF-hand
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7. 引用文献 (1)