1qzv

Crystal structure of plant photosystem I

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

当前条目没有可用的 UniProt 蛋白身份。

七张关系表仍保留该条目的 assembly 与组成信息，但缺少统一蛋白身份时，不能可靠建立跨 PDB 的同蛋白链接。

当前条目的 assembly 组成

Assembly	物理组成	蛋白状态	蛋白 / DNA / RNA / 其他聚合物	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	16 / 0 / 0 / 0	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	16 / 0 / 0 / 0	与蛋白数一致

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1qzv
沉积日期 deposition_date	2003-09-18
结构标题 title	Crystal structure of plant photosystem I
关键词 keywords	PHOTOSYNTHESIS, PLANT PHOTOSYNTHETIC REACTION CENTER, PERIPHERAL ANTENNA, LIGHT-HARVESTING SYSTEM, PLANT MEMBRANE PROTEIN COMPLEX; PHOTOSYNTHESIS
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1qzv__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1qzv__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1qzv__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	48.84 Å
Rg（电子密度）	48.71 Å
总 Rg	48.49 Å
原子数	4225
残基数	0
排除体积	667010 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1qzv__assembly_1__model_1`	hexadecameric （16）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`1qzv__assembly_2__model_1`	hexadecameric （16）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (19)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	PLANT PHOTOSYSTEM I: SUBUNIT PSAA
分子量 formula_weight	61804.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,P
原子数 atom_count	13938

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	PLANT PHOTOSYSTEM I: SUBUNIT PSAB
分子量 formula_weight	62314.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,Q

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	PLANT PHOTOSYSTEM I: SUBUNIT PSAC
分子量 formula_weight	6826.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,R

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	PLANT PHOTOSYSTEM I: SUBUNIT PSAD
分子量 formula_weight	13124.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,S

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	PLANT PHOTOSYSTEM I: SUBUNIT PSAE
分子量 formula_weight	5464.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,T

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	PLANT PHOTOSYSTEM I: SUBUNIT PSAF
分子量 formula_weight	13804.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,U

XXXXXXXXXXXXXXXXXEKQALKKLQASLKLYADDSAPALAIKATMEXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	PLANT PHOTOSYSTEM I: SUBUNIT PSAG
分子量 formula_weight	6315.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,V

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	PLANT PHOTOSYSTEM I: SUBUNIT PSAH
分子量 formula_weight	4443.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,W

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	PLANT PHOTOSYSTEM I: SUBUNIT PSAI
分子量 formula_weight	2571.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,Y

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	PLANT PHOTOSYSTEM I: SUBUNIT PSAJ
分子量 formula_weight	3507.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J,Z

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	PLANT PHOTOSYSTEM I: SUBUNIT PSAK
分子量 formula_weight	3592.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,5

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	PLANT PHOTOSYSTEM I: SUBUNIT PSAL
分子量 formula_weight	11507.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,6

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	PLANT LIGHT HARVESTING COMPLEX I(LHCI): SUBUNIT LHCA1
分子量 formula_weight	9294.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	1,7

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	PLANT LIGHT HARVESTING COMPLEX I(LHCI): SUBUNIT LHCA2
分子量 formula_weight	9805.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	2,8

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	PLANT LIGHT HARVESTING COMPLEX I(LHCI): SUBUNIT LHCA3
分子量 formula_weight	9975.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	3,9

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	PLANT LIGHT HARVESTING COMPLEX I(LHCI): SUBUNIT LHCA4
分子量 formula_weight	10145.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	4,0

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 17 Entity 17 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL A
分子量 formula_weight	893.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	334

实体 18 Entity 18 non-polymer

描述 description	PHYLLOQUINONE
分子量 formula_weight	450.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 19 Entity 19 non-polymer

描述 description	IRON/SULFUR CLUSTER
分子量 formula_weight	351.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 32 domains

SCOP 2.08 (32 domains)

结构域编号 domain_id	d1qzv0_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1qzv1_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1qzv2_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1qzv3_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1qzv4_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1qzv5_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1qzv6_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1qzv7_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1qzv8_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1qzv9_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1qzva_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1qzvb_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1qzvc_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1qzvd_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1qzve_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1qzvf_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1qzvg_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1qzvh_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1qzvi_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1qzvj_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1qzvk_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1qzvl_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1qzvp_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1qzvq_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1qzvr_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1qzvs_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1qzvt_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1qzvu_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1qzvv_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1qzvw_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1qzvy_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1qzvz_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

▶

晶胞边长 a length_a	182.283 Å
晶胞边长 b length_b	190.376 Å
晶胞边长 c length_c	220.253 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.48 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.440 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	0.4100
R_work r_work	0.4100
R_free r_free	0.4200

Crystal structure of plant photosystem I

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

当前条目的 assembly 组成

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1qzv__assembly_2__model_1

1qzv__assembly_2__model_1 | I(q)

1qzv__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (19)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

实体 7 Entity 7 polymer

聚合物 Polymer

实体 8 Entity 8 polymer

聚合物 Polymer

实体 9 Entity 9 polymer

聚合物 Polymer

实体 10 Entity 10 polymer

聚合物 Polymer

实体 11 Entity 11 polymer

聚合物 Polymer

实体 12 Entity 12 polymer

聚合物 Polymer

实体 13 Entity 13 polymer

聚合物 Polymer

实体 14 Entity 14 polymer

聚合物 Polymer

实体 15 Entity 15 polymer

聚合物 Polymer

实体 16 Entity 16 polymer

聚合物 Polymer

实体 17 Entity 17 non-polymer

实体 18 Entity 18 non-polymer

实体 19 Entity 19 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 32 domains

SCOP 2.08 (32 domains)

7. 引用文献 (1)