Tomato bushy stunt virus
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–RNA | 同源多聚体 | 蛋白 2 RNA 4 | 5'-R(*CP*GP*UP*AP*CP*GP*CP*GP*GP*AP*AP*UP*AP*CP*UP*UP*CP*GP*AP*UP*U)-3' × 2 5'-R(*UP*CP*GP*AP*AP*GP*UP*AP*UP*UP*CP*CP*GP*CP*GP*UP*AP*CP*GP*UP*U)-3' × 2 SULFATE ION × 4 water × 6 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | VP19_TBSVC |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 3 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 5–136； UniProt 27–158 |
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| 条目编号 entry_id | 1r9f |
| 沉积日期 deposition_date | 2003-10-28 |
| 结构标题 title | Crystal structure of p19 complexed with 19-bp small interfering RNA |
| 关键词 keywords | Protein-RNA complex, Dimer, double helix, Viral protein-RNA COMPLEX; Viral protein/RNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 20.91 Å |
| Rg（电子密度） | 20.49 Å |
| 总 Rg | 21.06 Å |
| 原子数 | 3564 |
| 残基数 | 314 |
| 排除体积 | 57150 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d1r9fa1 |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.255 — Tombusvirus P19 core protein, VP19 |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.255.1 — Tombusvirus P19 core protein, VP19 |
| 家族 Family family | d.255.1.1 — Tombusvirus P19 core protein, VP19 |
| 结构域编号 domain_id | d1r9fa2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | 1r9fA01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 390 — Enolase-like; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 180 — RNA silencing suppressor P19 |