Enterobacteria phage lambda
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 单体 | 蛋白 1 DNA 2 | 5'-D(*CP*TP*AP*TP*GP*TP*AP*GP*TP*CP*TP*GP*TP*TP*G)-3' × 1 5'-D(P*CP*AP*AP*CP*AP*GP*AP*CP*TP*AP*CP*AP*TP*AP*G)-3' × 1 water × 3 | 与全部聚合物一致 |
| 2 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | VXIS_LAMBD |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 3 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–55； UniProt 1–55 作者链 B； PDB构建体 1–55； UniProt 1–55 |
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| 条目编号 entry_id | 1rh6 |
| 沉积日期 deposition_date | 2003-11-13 |
| 结构标题 title | Bacteriophage Lambda Excisionase (Xis)-DNA Complex |
| 关键词 keywords | ;Protein-DNA complex, DNA architectural protein, 'winged'-helix protein, phage excision, site-specific DNA recombination, DNA BINDING PROTEIN-DNA COMPLEX ;; DNA BINDING PROTEIN/DNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 12.64 Å |
| Rg（电子密度） | 11.17 Å |
| 总 Rg | 12.72 Å |
| 原子数 | 478 |
| 残基数 | 55 |
| 排除体积 | 8449 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d1rh6a_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.6 — Putative DNA-binding domain |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.6.1 — Putative DNA-binding domain |
| 家族 Family family | a.6.1.7 — Excisionase-like |
| 结构域编号 domain_id | d1rh6b_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.6 — Putative DNA-binding domain |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.6.1 — Putative DNA-binding domain |
| 家族 Family family | a.6.1.7 — Excisionase-like |
| 结构域编号 domain_id | 1rh6A00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 1660 — Multidrug-efflux Transporter Regulator; Chain: A; Domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 20 — Excisionase (Xis) protein |
| 结构域编号 domain_id | 1rh6B00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 1660 — Multidrug-efflux Transporter Regulator; Chain: A; Domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 20 — Excisionase (Xis) protein |