putative isomerase ybhE
Escherichia coli
当前结构中的状态
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | water × 1 | 与蛋白数一致 |
数据库中的同蛋白其他状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | 6PGL_ECOLI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 4–333； UniProt 2–331 |
1ri6
Structure of a putative isomerase from E. coli
1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
2. 结构基本信息 2. Structure Basics
| 条目编号 entry_id | 1ri6 |
| 沉积日期 deposition_date | 2003-11-16 |
| 结构标题 title | Structure of a putative isomerase from E. coli |
| 关键词 keywords | ;ISOMERASE, 7-BLADED PROPELLER, ENZYME, PSI, Protein Structure Initiative, New York SGX Research Center for Structural Genomics, NYSGXRC, STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION ;; STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
1ri6__assembly_1__model_1
Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
1ri6__assembly_1__model_1 | I(q)
1ri6__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending
| Rg（Guinier） | 19.87 Å |
| Rg（电子密度） | 18.64 Å |
| 总 Rg | 19.52 Å |
| 原子数 | 2574 |
| 残基数 | 333 |
| 排除体积 | 45210 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment
5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)
6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains
SCOP 2.08 (3 domains)
| 结构域编号 domain_id | d1ri6a1 |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.69 — 7-bladed beta-propeller |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.69.11 — Putative isomerase YbhE |
| 家族 Family family | b.69.11.1 — Putative isomerase YbhE |
| 结构域编号 domain_id | d1ri6a2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | d1ri6a3 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
CATH v4.4 (1 domains)
| 结构域编号 domain_id | 1ri6A00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 130 — 7 Propeller |
| 拓扑 Topology topology | 10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase |